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Enregistrement W2981492897 · doi:10.1101/19007278

Epidemiology and predictors of repeat positive chlamydia tests: The Brant County cohort, Ontario, Canada

2019· preprint· en· W2981492897 sur OpenAlexaffabout
Jenny Pereira Santos, Alexey Babayan, Miao Huang, Ann Jolly

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensBrantford Energy (Canada)University of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChlamydiaGonorrheaMedicineEpidemiologyDemographyPublic healthCohortProportional hazards modelRetrospective cohort studyNotifiable diseaseCohort studyGynecologyInternal medicineFamily medicineImmunologyHuman immunodeficiency virus (HIV)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Objectives Repeat positive tests for chlamydia (CR) may help explain current high rates of chlamydia despite years of screening, partner notification and treatment to reduce sequelae. We wanted to determine the numbers of CRs over time as a proportion of all chlamydia cases, and define the differences in demographic, clinical, behavioural, and public health management indicators, between individuals who have experienced a CR and individuals who experienced a single infection in Brant County, Ontario. Methods A retrospective cohort was developed using notifiable disease data extracted from the integrated public health system. Cases were laboratory confirmed chlamydia and gonorrhea infections in Brant County between January 1 st , 2006 and December 31 st , 2015. During the study period, 3,499 chlamydia cases and 475 gonorrhea cases were diagnosed. The total number of individuals with chlamydia in that period was 3,060, including 157 coinfections with gonorrhea. Differences between those with reinfection and those with single infection were evaluated using univariate and multivariate (Cox proportional hazards model) methods. Results Four hundred and ninety-nine (16.30%) individuals experienced CR 28 days from initial infection; of which 328 (65.73%) occurred within 2 years and 211 (42.28%) within 1 year. The median time to CR was 276 days, consistent with existing Canadian literature. Independent risk factors for CR included being male, 25 years old or younger, and not receiving recommended treatment for initial and/or subsequent infection. Conclusions These findings suggest that inadequate treatment play a significant role in CR, while accounting for young age and male gender, likely due to untreated sex partners. Key Messages Sixteen percent of people experienced a second positive chlamydia test more than 28 days after their initial positive test in a cohort of 3,499 patients Those who had a second positive test were more likely to be male, younger than 25 and had not received recommended antimicrobials Confirmation of any kind of partner notification was missing in 88% of records

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,111

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,004
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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