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Enregistrement W2981556778 · doi:10.33594/000000068

Post-Transcriptional Modulation of αENaC mRNA in Alveolar Epithelial Cells: Involvement of its 3’ Untranslated Region

2019· article· en· W2981556778 sur OpenAlexafffund
Francis Migneault, Frédéric Gagnon, Mihai Pascariu, Jonathan Laperle, Antoine Roy, André Dagenais, Yves Berthiaume

Notice bibliographique

RevueCellular Physiology and Biochemistry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversité de Montréal
Mots-clésEpithelial sodium channelMessenger RNAGene knockdownUntranslated regionThree prime untranslated regionMolecular biologyRNACell biologyBiologyChemistryGeneGeneticsSodium

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND/AIMS: The epithelial sodium channel (ENaC) expressed in alveolar epithelial cells plays a major role in lung liquid clearance at birth and lung edema resorption in adulthood. We showed previously that αENaC mRNA expression is downregulated in part via posttranscriptional regulation of mRNA stability. In the present work, the role of the αENaC 3' untranslated region (3'UTR) in the regulation of mRNA stability was studied further. METHODS: Quantitative reverse transcription PCR (qRT-PCR) was performed to investigate the expression of αENaC in alveolar epithelial cells. The role of the αENaC 3'UTR was evaluated through sequential deletions. RNA affinity chromatography and mass spectrometry were achieved to investigate the nature of the proteins that could bind this sequence. The function of these proteins was assessed through knockdown and overexpression in vitro. RESULTS: First, we found that αENaC mRNA half-life was much shorter than expected when using a transcriptionally controlled plasmid expression system compared to Actinomycin D treatment. Sequential deletions of the αENaC 3'UTR revealed that the αENaC 3'UTR plays an important role in the modulation of αENaC mRNA stability, and that there is a complex stabilizing and destabilizing interplay between different regions of the 3'UTR that modulate this process. Finally, we identified RNA-binding proteins that interact with the αENaC 3'UTR and showed that Dhx36 and Tial1 are involved in the decrease in αENaC mRNA stability via the proximal region of its 3'UTR. CONCLUSION: Taken together, these findings indicate that the αENaC 3'UTR plays an important role in modulating transcript levels, and Dhx36 and Tial1 seem to be involved in posttranscriptional regulation of αENaC expression in alveolar epithelial cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,561

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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