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Enregistrement W2981579438 · doi:10.4330/wjc.v11.i10.221

Cellular models for human cardiomyopathy: What is the best option?

2019· review· en· W2981579438 sur OpenAlexaff
Nerea Jiménez-Téllez, Steven C. Greenway

Notice bibliographique

RevueWorld Journal of Cardiology · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInduced pluripotent stem cellMedicineDiseaseCardiomyopathyMechanism (biology)BioinformaticsMitochondrial diseaseDrug discoveryComputational biologyNeuroscienceHeart failurePathologyBiologyInternal medicineEmbryonic stem cellGeneticsMitochondrial DNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genetic cardiomyopathies are a group of disorders related by abnormal myocardial structure and function. Although individually rare, these diseases collectively represent a significant health burden since they usually develop early in life and are a major cause of morbidity and mortality amongst affected children. The heterogeneity and rarity of these disorders requires the use of an appropriate model system in order to characterize the mechanism of disease and develop useful therapeutics since standard drug trials are infeasible. A common approach to study human disease involves the use of animal models, especially rodents, but due to important biological and physiological differences, this model system may not recapitulate human disease. An alternative approach for studying the metabolic cardiomyopathies relies on the use of cellular models which have most frequently been immortalized cell lines or patient-derived fibroblasts. However, the recent introduction of induced pluripotent stem cells (iPSCs), which have the ability to differentiate into any cell type in the body, is of great interest and has the potential to revolutionize the study of rare diseases. In this paper we review the advantages and disadvantages of each model system by comparing their utility for the study of mitochondrial cardiomyopathy with a particular focus on the use of iPSCs in cardiovascular biology for the modeling of rare genetic or metabolic diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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