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Enregistrement W2981599231 · doi:10.1093/ofid/ofz359.090

1828. Bedaquiline Resistance in Mycobacterium intracellulare Is Mediated by the Transcriptional Repressor MmpT5

2019· article· en· W2981599231 sur OpenAlexaff
David C. Alexander, Joshua Yoneda, Supriya V. Bhat, Teagan Oleksyn, Jeffrey Chen, Cameron Andrew

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensInterDigital (Canada)University of SaskatchewanUniversity of Regina
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBedaquilineMycobacterium smegmatisMutantAntimycobacterialEffluxMicrobiologyWild typeBiologyMycobacterium tuberculosisGeneMolecular biologyTuberculosisMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Bedaquiline (BDQ) is an FDA approved antibiotic with antimycobacterial activity. BDQ resistance has been observed in several Mycobacterium species. High-level resistance is due to mutations in ATP synthase. Low -level resistance is attributed to drug efflux. Previously, we suggested that the MmpSL5 efflux system mediates BDQ resistance in M. intracellulare. Here, we examine the role of MmpT5 in transcriptional regulation of mmpSL5 and BDQ resistance. Methods In this study, mmpSL5-mmpT5 genes were cloned from 2 pre-treatment (wild-type mmpT5) and 2 relapse (mutant mmpT5) isolates of M. intracellulare and transformed into M. smegmatis. BDQ MICs were determined as well as cell survival after 24 hours exposure to an inhibitory concentration (0.07 µg/mL) of BDQ. Transcription of the M. intracellulare mmpT5 and mmpSL5 promoters was monitored with luciferase reporter gene fusions in the presence of wild-type and mutant alleles of mmpT5. Single and multigene constructs were created using the MoClo system, and transformed into E. coli DH5α. Constructs containing the M. tuberculosis rv0678 gene, which mediates low-level BDQ resistance in M. tuberculosis, were also examined. Results The BDQ MIC for the M. smegmatis control strain, and all strains containing mmpSL5-mmpT5 constructs, was 0.007 µg/mL. Even so, strains containing mutant mmpT5 alleles showed enhanced survival after 24 hours exposure to 0.007 µg/mL BDQ. Bacterial colonies associated with mutant mmpT5 alleles exhibited altered morphology relative to wild-type strains. Transcription of mmpSL5 was repressed by wild-type mmpT5, but neither mutant mmpT5 nor rv0678 repressed transcription. The mmpT5 luciferase reporter was not active. Conclusion MmpT5 represses transcription of mmpSL5 whereas the operon is dysregulated by mmpT5 mutations. Although Rv0678 regulates mmpSL expression in M. tuberculosis, it cannot repress the M. intracellulare mmpSL5 genes. The mmpSL5-mmpT5 genes have no impact on the BDQ MIC for M. smegmatis, but constructs containing mutant mmpT5 alleles do enhance bacterial survival. The altered morphology of these colonies suggests that BDQ resistance is mediated by cell wall changes in combination with drug efflux. Disclosures All Authors: No reported Disclosures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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