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Enregistrement W2981684899 · doi:10.1016/j.omtn.2019.10.015

Characterization of a Prostate- and Prostate Cancer-Specific Circular RNA Encoded by the Androgen Receptor Gene

2019· article· en· W2981684899 sur OpenAlexafffund
Jindan Luo, Yinan Li, Wei Zheng, Ning Xie, Zhi Long, Liping Xie, Ladan Fazli, Dahong Zhang, Martin Gleave, Xuesen Dong

Notice bibliographique

RevueMolecular Therapy — Nucleic Acids · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Zhejiang ProvinceCanadian Institutes of Health ResearchChina Scholarship Council
Mots-clésProstate cancerAndrogen receptorCancer researchProstateCircular RNABiologyPCA3Alternative splicingLong non-coding RNARNAGeneCancerMessenger RNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The linear mRNAs transcribed under alternative RNA splicing and overexpression/amplification of the androgen receptor (AR) gene are poor prognostic biomarkers of castrate-resistant prostate cancer (PCa). Whether the AR gene also transcribes non-coding circular RNAs that are associated with PCa development and tumor progression remains unclear. Here, we identified and characterized an AR circular RNA, called circAR3, that is widely expressed in PCa cell models and prostate tumors. circAR3 can be secreted into culture media of PCa cell lines and is detectable in the serum from mice bearing PCa xenografts. In PCa patient tissues, circAR3 is highly expressed in benign prostate and hormone naive PCa but downregulated when tumors were treated with neoadjuvant hormone therapy and further reduced when tumors progressed to the castrate-resistant stage. However, circAR3 levels in plasma are extremely low in patients with benign prostate, are upregulated in PCa patients with high Gleason scores and lymph node metastasis, and become undetectable in men after radical prostatectomy. circAR3 does not affect AR signaling, PCa cell proliferation, and invasion rates. Our results demonstrated that the origin of the detectable plasma circAR3 is from the prostate/PCa. Plasma circAR3 may be developed to be a PCa biomarker to monitor PCa development and tumor progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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