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Enregistrement W2981691987 · doi:10.5539/jmbr.v9n1p133

The Association between Functional Polymorphisms of COX-2 and Serum PGE2 Level in ESCC Patients in North of Iran

2019· article· en· W2981691987 sur OpenAlexvenueno aff
Maryam Sadegh Sheshpoli, Safoura Khajeniazie, Masoud Khoshnia, Nasser Behnampour, Mohsen Saeedi

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Biology Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory mediators and NSAID effects
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInternal medicineEsophageal cancerSingle-nucleotide polymorphismProstaglandin E2OncologyGenotypeImmunohistochemistryCancerProportional hazards modelBiomarkerGastroenterologyGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Esophageal cancer is recognized as one of the most fatal diseases around the world. Many factors are involved in the development of esophageal cancer, including genetic factors and inflammation. Cyclooxygenase-2 (COX-2) and its downstream signaling are the most important proinflammatory factors contributing to cancer. The present study aimed to evaluate the relationship between the polymorphisms and expression of COX-2 and prostaglandin-E2 (PGE2) level in patients with esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) in Golestan Province (Iran), situated on the “esophageal cancer belt”. Methods: In this case-control study, blood and biopsy samples were obtained from ESCC patients and healthy controls. The COX-2 polymorphisms for -1195, -1290, -765, and +8473 SNPs were assayed using PCR-RFLP assay, while the level of PGE2 was measured using an ELISA kit. In addition, real-time PCR assay and immunohistochemistry (IHC) were performed to assay mRNA and protein expression of COX-2, respectively. Results: An association was found between 8473TC genotype and risk of ESCC (OR= 5.417, P= 0.036). In addition, mRNA and protein expression of COX-2 in ESCC patients was higher than the controls (P=0.001 and P=0.048, respectively). Based on the findings, the level of PGE-2 was significantly higher in ESCC patients, compared to the controls (P= 0.045). However, ROC curve analysis revealed PGE2 is a weak biomarker for diagnosis of ESCC. There was a significant relationship between the level of PGE2 and 8473CC, 8473TC, -765CC, and -1290AA genotypes (P= 0.028, P= 0.022, P= 0.024, and P= 0.011, respectively). Conclusion: Based on our results, functional polymorphisms of COX-2 (8473CC, 8473TC, - 765CC, and -1290AA) increase PGE2 level and carriers of these polymorphisms might be more susceptible to ESCC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,222

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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Résumé présentoui

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