MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2981774387 · doi:10.1038/s41467-019-12798-y

Fungal-bacterial diversity and microbiome complexity predict ecosystem functioning

2019· article· en· W2981774387 sur OpenAlexaff
Cameron Wagg, Klaus Schlaeppi, Samiran Banerjee, Eiko E. Kuramae, Marcel G. A. van der Heijden

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgroscopeKoninklijke Nederlandse Akademie van WetenschappenSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNederlands Instituut voor EcologieNational Science Foundation
Mots-clésEcosystemMicrobiomeMicrocosmEcologyBiologyNutrient cycleSpecies richnessGrasslandBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The soil microbiome is highly diverse and comprises up to one quarter of Earth's diversity. Yet, how such a diverse and functionally complex microbiome influences ecosystem functioning remains unclear. Here we manipulated the soil microbiome in experimental grassland ecosystems and observed that microbiome diversity and microbial network complexity positively influenced multiple ecosystem functions related to nutrient cycling (e.g. multifunctionality). Grassland microcosms with poorly developed microbial networks and reduced microbial richness had the lowest multifunctionality due to fewer taxa present that support the same function (redundancy) and lower diversity of taxa that support different functions (reduced functional uniqueness). Moreover, different microbial taxa explained different ecosystem functions pointing to the significance of functional diversity in microbial communities. These findings indicate the importance of microbial interactions within and among fungal and bacterial communities for enhancing ecosystem performance and demonstrate that the extinction of complex ecological associations belowground can impair ecosystem functioning.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 791
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetMicrobial Community Ecology and PhysiologyTravaux en français237 207