MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2981871046 · doi:10.1093/ofid/ofz360.581

512. Healthcare-Acquired (HA) Carbapenemase-Producing Enterobacteriales (CPE) in Southern Ontario, Canada: To Whom Are We Transmitting CPE?

2019· article· en· W2981871046 sur OpenAlexaffabout
Alainna Jamal, Brenda L. Coleman, Jennie Johnstone, Kevin Katz, Matthew Muller, Samir N. Patel, Roberto G. Melano, Anu Rebbapragada, David Richardson, Alicia Sarabia, Samira Mubareka, Susan M. Poutanen, Zoë Zhong, Philipp Köhler, Allison McGeer

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensHealth Sciences CentreTrillium Health CentreWilliam Osler Health SystemBrampton Civic HospitalToronto Public HealthSt. Michael's HospitalSunnybrook Health Science CentreNorth York General HospitalSinai Health SystemPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineIncidence (geometry)Christian ministryOutbreakPopulationEmergency medicineAuditInfection controlDemographyEnvironmental healthSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Though CPE in Canada are mainly acquired abroad, outbreaks/transmission in Canadian hospitals have been reported. We determined the incidence of HA CPE in southern Ontario, Canada, to inform prevention and control programs. Methods Toronto Invasive Bacterial Diseases Network (TIBDN) has performed population-based surveillance for CPE in the Toronto area/Peel region of southern Ontario, Canada, since CPE were first identified in October 2007. Clinical microbiology laboratories report all CPE isolates to TIBDN; annual lab audits are performed. Incidence calculations used first isolates as numerator; denominator (patient-days/fiscal year for Toronto/Peel hospitals) was from the Ontario Ministry of Health and Long-Term Care. Results The incidence of HA CPE has risen from 0 in 2007/2008 to 0.45 and 0.28 per 100,000 patient-days for all and clinical cases, respectively, in 2017/2018 (Figure, P < 0.0001). 190/790 (24%) incident cases of CPE colonization/infection in southern Ontario from October 2007 to December 2018 were likely HA (hospitalized in Ontario with no history of hospitalization abroad/high-risk travel). Eighty (25%) were female and the median age was 73 years (IQR 57–83 years). 157 (83%) had no prior travel abroad and 33 (17%) had prior low-risk travel. 122 (64%) had their CPE identified >72 hours post-admission (of which 83 also had ≥1 other prior Ontario hospitalization); 68 (36%) had their CPE identified at admission but had recent prior Ontario hospitalization. HA cases vs. foreign acquisitions were significantly more likely K. pneumoniae (48% vs. 38%, P = 0.02) and Enterobacter spp. (20% vs. 7%, P < 0.0001) and less likely E. coli (20% vs. 48%, P < 0.0001). Genes of HA vs. foreign acquisitions were significantly more likely blaKPC (34% vs. 12%, P < 0.0001) and blaVIM (12% vs. 2%, P < 0.0001) and less likely blaNDM±OXA (38% vs. 56%, P < 0.0001) and blaOXA (13% vs. 27%, P = 0.0001). 36 (19%) HA cases had a negative CPE screen before their first positive CPE test (10/36 (28%) were on admission). The median incidence of HA CPE per 100,000 patient-days at each hospital was 0.44 (IQR 0.15–0.68) (P < 0.0001). Conclusion A quarter of CPE cases in southern Ontario were HA and the incidence of HA cases is increasing. Most cases were admitted to >1 Ontario hospital. Strategies to control transmission are critical. Disclosures All authors: No reported disclosures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,157
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOpen Forum Infectious DiseasesMême sujetAntibiotic Resistance in BacteriaTravaux en français237 207