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Enregistrement W2981879713 · doi:10.1093/ofid/ofz360.1091

1228. Risk Factors for Contamination with Carbapenemase-Producing Enterobacteriales (CPE) in Exposed Hospital Drains in Ontario, Canada

2019· article· en· W2981879713 sur OpenAlex
Alainna Jamal, Kevin A. Brown, Kevin Katz, Jennie Johnstone, Matthew Muller, Vanessa Allen, Sergio Borgia, David A. Boyd, William Ciccotelli, Kornelija Delibasic, David N. Fisman, Jerome A. Leis, Angel Li, Laura Mataseje, Mamta Mehta, Michael R. Mulvey, Wil Ng, Rajni Pantelidis, Aimee Paterson, Allison McGeer

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEnterobacteriaceae and Cronobacter Research
Établissements canadiensHealth Sciences CentreMarkham Stouffville HospitalGrand River HospitalPublic Health Agency of CanadaWilliam Osler Health SystemSt. Michael's HospitalSunnybrook Health Science CentreSinai Health SystemNorth York General HospitalPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineHygieneSink (geography)OutbreakContaminationInternal medicineSurgeryBiologyVirologyEcologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Hospital drains may be a source of CPE in patients. We determined prevalence of and risk factors for CPE contamination of hospital drains exposed to patients with CPE colonization/infection. Methods We cultured hand hygiene and patient use sink as well as tub/shower drains exposed to 310 inpatients colonized/infected with CPE in 10 Ontario hospitals. A multi-level logistic regression model was fitted to determine whether type of drain/room/unit was associated with CPE drain contamination. Drain and room occupant CPE isolates underwent Illumina whole-genome and MinION sequencing. Single nucleotide variant (SNV) phlogenomic analyses and plasmid characterization were performed. Results 53/ Of the 1,209 drains, 53 (4%) at 7 (70%) hospitals yielded CPE. Patient room shower drains were significantly more likely to yield CPE than hand hygiene sink (OR 3.35, 95% CI 1.61–6.97) and patient use sink (OR 10.89, 95% CI 3.62–32.80) drains. Hand hygiene sink drains were significantly more likely to yield CPE than patient use sink drains (OR 3.26, 95% CI 1.05–10.13). 8 (15%) drain isolates matched the room occupant CPE gene/species; 24 (44%) matched the gene but not species, and 23 (42%) matched neither gene nor species. Among 13 drain/11 room occupant pairs with molecular comparisons to date, only 1/13 (8%) drain isolates matched the respective room occupant carbapenemase allele and replicon harboring the carbapenemase gene (IncN replicon harboring blaKPC-3). In addition, one drain isolate had a plasmid highly related to plasmids of 2 isolates from a patient occupying a room in an adjacent unit (IncN3 replicons harboring blaKPC-2). At another hospital, all 6 drain isolates were located on one unit and had an IncHI2A/HI2/TrfA replicon harboring blaNDM-1; 5 of these were E. cloacae ST66, with 0–3 SNV differences observed between isolates. Conclusion Different drain types have different risks of CPE contamination. In our setting, most drain contamination was not caused by recognized room occupants. Further investigation is needed to understand the sources of hospital drain CPE contamination. Disclosures All authors: No reported disclosures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,146
Score d'incertitude au seuil0,811

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle