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Enregistrement W2981888276 · doi:10.1093/ofid/ofz360.535

462. Prospective Surveillance of Invasive Group A Streptococcal Infections in Toronto, Ontario, Canada: 1992–2017

2019· article· en· W2981888276 sur OpenAlexaffabout
Christopher Kandel, Nick Daneman, Walter Demczuk, Wayne L. Gold, Karen Green, Irene Martín, Agron Plevneshi, Jeff Powis, Wallis Rudnick, Alicia Sarabia, Benjamin Schwartz, Andrew E. Simor, Greg Tyrrell, Louis Valiquette, Allison McGeer

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversité de SherbrookeTrillium Health CentreUniversity of AlbertaPublic Health Agency of CanadaSinai Health SystemUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineIncidence (geometry)Confidence intervalEpidemiologyCase fatality rateBacteremiaPopulationFasciitisInternal medicineDemographySurgeryAntibioticsEnvironmental healthMicrobiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background. Background Invasive Group A streptococcal (iGAS) infections remain a substantial source of morbidity and mortality. We explore the clinical and molecular epidemiology of iGAS infections in Toronto, Ontario, Canada over a 26-year period. Methods The Toronto Invasive Bacterial Diseases Network has performed population-based surveillance for iGAS infections in metropolitan Toronto and Peel regions since 1992. Participating microbiology laboratories report and submit sterile site specimens for central processing. M typing was performed on iGAS isolates until September 2006; thereafter emm typing was performed. Clinical information was collected by chart review using standardized collection forms. Results Over the 26-year period there were 2819 iGAS infections, representing an average incidence of 2.85 per 100,000 residents with a nadir of 1.65 in 1993 and a peak of 4.52 in 2014. Nosocomial infections occurred in 8.9% (251/2,819). There was substantial variation in annual incidence rates over the study period with increases from 1992 until 2002 and then 2004 until 2014 (analysis for trend, P < 0.001). Skin and soft-tissue infections were the most common clinical presentation, accounting for 33.2% (936/2,819), followed by bacteremia without a focus in 15.4% (435/2,819). Necrotizing fasciitis was observed in 7.4% (208/2,819) and criteria for toxic shock syndrome were met in 17.6% (497/2,819). Overall case fatality within 30 days of hospitalization was 15.3% (95% confidence interval 14.0 to 16.6) and did not change over time. M serotype distribution varied yearly with the most common type being M1 at 22.2% (626/2,189) followed by M12 at 8.2% (230/2,189), then M89 at 5.8% (163/2,189). Antibiotic susceptibility was available from 1998 onwards with overall clindamycin susceptibility at 92.3% (1,957/2,121) and erythromycin susceptibility at 87.9% (1864/2,121). Conclusion The incidence of iGAS in Toronto, Ontario has varied over time, with no recent increase apparent. Similar to worldwide observations, M1 serotype was the most commonly isolated; most common serotypes demonstrated cyclical variation. Case fatality rates have remained relatively constant making the development of a vaccine imperative. Disclosures All authors: No reported disclosures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,143

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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