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Enregistrement W2981915086 · doi:10.29011/2577-2139.000005

Re-Evaluating the Current ANCA Screening Method: Multiplex Indirect Immunofluorescence Assay in ANCA Testing

2017· article· en· W2981915086 sur OpenAlexaff
Whitney Reinhart, Yvette Gallan, Tina Godbout, Donglai Ma

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Clinical Pathology and Diagnosis · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensDr. Everett Chalmers Regional HospitalMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMultiplexImmunofluorescenceIndirect immunofluorescenceMedicineAntibodyImmunologyBiologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective:The Indirect Immunofluorescent Test (IIFT) method is a crucial component of Anti-Neutrophil Cytoplasmic Antibodies (ANCA) diagnostics as it is the only method that can be used to detect not only small vessel vasculitis related ANCA, but also ANCAs in Chronic Inflammatory Bowel Disease (CIBD) and other disease conditions.The conventional IIFT method only uses ethanol fixed granulocytes for initial testing, which results in a lack of specificity.The purpose of this study is to outline an improvement in the screening and interpretation of ANCA by IIFT, using a 3-chip combination per incubation well.With the inclusion of an ethanol fixed granulocyte chip, formalin fixed granulocyte chip, and mixed cell chip containing both ethanol fixed granulocytes and HEp-2 cells, we aim to demonstrate a reduction in the number of false positives and false negatives, increase ANCA testing specificity without the loss of sensitivity, as well as simplify the reporting.Design/Method: 261 serum samples were obtained from the serum bank of Euroimmun Canada.Each sample was tested for both Anti-Nuclear Antibodies (ANA) and ANCA (3-chip combination) using IIFT, and was also tested using Anti-MPO/PR3 ELISA.ANCA profile (including six antigens) ELISA was used as well.All reagents were from Euroimmun.Results: Distinct ANCA patterns were identified according to our simplified scheme, including: ANCA (c-or p-ANCA), atypical ANCA (atypical c-or p-ANCA) and atypical inconclusive ANCA.The use of a 3-chip combination eliminated ANA interference and resulted in a significant reduction of 75.6% in the unsure "positive" ANCA results that were initially determined from using ethanol fixed granulocytes only.The ethanol fixed granulocyte chip and formalin fixed granulocyte chip are important for pattern classification, while the mixed cell chip is crucial for differentiating true positive ANCA from ANA interference.Noticeably, this IIFT 3-chip combination testing revealed 5% more true ANCA positive samples, which were ANCA negative when using ethanol fixed granulocytes only as the initial screening. Conclusion:The use of a 3-chip combination multiplex IIFT approach is necessary for an accurate interpretation and analysis of patient serum for ANCA screening.This proposed inclusion of additional substrates in the IIFT ANCA diagnostic procedure has shown to result in increasing specificity of the IIFT, while maintaining a high sensitivity.The simplified reporting also makes the ANCA result standardization a reality.ANCA IIFT method continues to be very useful in routine testing for different groups of diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,054

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,278
Tête enseignante GPT0,531
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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