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Enregistrement W2982036840 · doi:10.3390/cancers11101615

Size and Shape Filtering of Malignant Cell Clusters within Breast Tumors Identifies Scattered Individual Epithelial Cells as the Most Valuable Histomorphological Clue in the Prognosis of Distant Metastasis Risk

2019· article· en· W2982036840 sur OpenAlexaff
Velicko Vranes, Nemanja Rajković, Xingyu Li, Konstantinos N. Plataniotis, Nataša Todorović‐Raković, Jelena Milovanović, Ksenija Kanjer, Marko Radulović, Nebojša T. Milošević

Notice bibliographique

RevueCancers · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMinistarstvo Prosvete, Nauke i Tehnološkog Razvoja
Mots-clésBreast cancerStromaCytokeratinMetastasisMedicineReceiver operating characteristicPathologyOncologyInternal medicineCancerImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Survival and life quality of breast cancer patients could be improved by more aggressive chemotherapy for those at high metastasis risk and less intense treatments for low-risk patients. Such personalized treatment cannot be currently achieved due to the insufficient reliability of metastasis risk prognosis. The purpose of this study was therefore, to identify novel histopathological prognostic markers of metastasis risk through exhaustive computational image analysis of 80 size and shape subsets of epithelial clusters in breast tumors. The group of 102 patients had a follow-up median of 12.3 years, without lymph node spread and systemic treatments. Epithelial cells were stained by the AE1/AE3 pan-cytokeratin antibody cocktail. The size and shape subsets of the stained epithelial cell clusters were defined in each image by use of the circularity and size filters and analyzed for prognostic performance. Epithelial areas with the optimal prognostic performance were uniformly small and round and could be recognized as individual epithelial cells scattered in tumor stroma. Their count achieved an area under the receiver operating characteristic curve (AUC) of 0.82, total area (AUC = 0.77), average size (AUC = 0.63), and circularity (AUC = 0.62). In conclusion, by use of computational image analysis as a hypothesis-free discovery tool, this study reveals the histomorphological marker with a high prognostic value that is simple and therefore easy to quantify by visual microscopy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,140
Score d'incertitude au seuil0,479

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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