MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2982180499 · doi:10.1097/mpg.0000000000002522

Assessing the Validity of Adult‐derived Prognostic Models for Primary Sclerosing Cholangitis Outcomes in Children

2019· article· en· W2982180499 sur OpenAlexaff
Mark Deneau, Pamela L. Valentino, Cara L. Mack, Khaled Alqoaer, Mansi Amin, Achiya Amir, Madeleine Aumar, Marcus Auth, Annemarie Broderick, Matthew DiGuglielmo, Laura G. Draijer, Wael El‐Matary, Federica Ferrari, Katryn N. Furuya, Frédèric Gottrand, Nitika Gupta, Matjaž Homan, M. Kyle Jensen, Binita M. Kamath, Kyung Mo Kim, Kaija‐Leena Kolho, Bart G.P. Koot, Raffaele Iorio, Mercedes Martínez, Tamir Miloh, Parvathi Mohan, Sirish Palle, Alexandra Papadopoulou, Amanda Ricciuto, Lawrence J. Saubermann, Pushpa Sathya, Eyal Shteyer, Vratislav Smolka, Atsushi Tanaka, Raghu Varier, Veena Venkat, Bernadette Vitola, Marek Woynarowski, Stephen L. Guthery

Notice bibliographique

RevueJournal of Pediatric Gastroenterology and Nutrition · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Diseases and Immunity
Établissements canadiensMemorial University of NewfoundlandUniversity of TorontoUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Center for Research ResourcesSusan G. Komen for the Cure
Mots-clésMedicinePrimary sclerosing cholangitisPrimary (astronomy)Internal medicinePediatricsDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Natural history models for primary sclerosing cholangitis (PSC) are derived from adult patient data, but have never been validated in children. It is unclear how accurate such models are for children with PSC. METHODS: We utilized the pediatric PSC consortium database to assess the Revised Mayo Clinic, Amsterdam-Oxford, and Boberg models. We calculated the risk stratum and predicted survival for each patient within each model using patient data at PSC diagnosis, and compared it with observed survival. We evaluated model fit using the c-statistic. RESULTS: Model fit was good at 1 year (c-statistics 0.93, 0.87, 0.82) and fair at 10 years (0.78, 0.75, 0.69) in the Mayo, Boberg, and Amsterdam-Oxford models, respectively. The Mayo model correctly classified most children as low risk, whereas the Amsterdam-Oxford model incorrectly classified most as high risk. All of the models underestimated survival of patients classified as high risk. Albumin, bilirubin, AST, and platelets were most associated with outcomes. Autoimmune hepatitis was more prevalent in higher risk groups, and over-weighting of AST in these patients accounted for the observed versus predicted survival discrepancy. CONCLUSIONS: All 3 models offered good short-term discrimination of outcomes but only fair long-term discrimination. None of the models account for the high prevalence of features of autoimmune hepatitis overlap in children and the associated elevated aminotransferases. A pediatric-specific model is needed. AST, bilirubin, albumin, and platelets will be important predictors, but must be weighted to account for the unique features of PSC in children.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,041
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,106

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,041
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Pediatric Gastroenterology and NutritionMême sujetLiver Diseases and ImmunityTravaux en français237 207