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Enregistrement W2982209606 · doi:10.1093/cdn/nzz044.p08-131-19

Metabolomic Characterization of a Novel Pig Model of Pediatric Non-alcoholic Fatty Liver Disease (P08-131-19)

2019· article· en· W2982209606 sur OpenAlexaff
Michael La Frano, Gabriella V. Hernandez, Victoria Smith, Dan Columbus, Daniel G. Peterson, Rob Fanter, Christopher L. Kitts, Douglas G. Burrin, Magdalena Maj, Rodrigo Manjarín

Notice bibliographique

RevueCurrent Developments in Nutrition · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensGenome Prairie
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetabolomicsMetabolomeFatty liverInternal medicineMethionineCholineEndocrinologyMetabolic syndromeBiologyMetaboliteMedicineAmino acidBiochemistryDiseaseObesityBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) is a leading nutrition-linked liver disease in children. We have recently identified the neonatal Iberian pig as a novel model of pediatric NAFLD. Interestingly, feeding a high fructose-high fat (HFF) diet to neonatal Iberian pigs for 10 weeks did not induce obesity and decreased high and low density lipoproteins in serum, while the liver exhibited many of the histological features of pediatric NAFLD. In this study we utilized a metabolomics approach to characterize the metabolic phenotype of this pig model. Plasma and liver samples collected from Iberian pigs fed control, HFF, control + probiotic and HFF + probiotic diets were analyzed by LC-MS using targeted assays for primary metabolomics, aminomics, and lipidomics. Data was analyzed with multivariate statistics and 2-way ANOVA with t-tests adjusted for false discovery rate. Results from multivariate tests indicated no diet × probiotic interaction or probiotic effect, so only the main effect of diet is shown. A total of 224 and 218 metabolites were identified in the plasma and liver, respectively. In agreement with previous NAFLD models, the HFF diet increased hepatic branched chain amino acids, cholesteryl esters, hydroxyproline, plasma acylcarnitines and primary bile acids, and altered hepatic triacylglycerol-species composition (P < 0.0001). In addition, HFF pigs had increased homocysteine and methionine levels combined with a decrease in pyridoxate in liver (P < 0.0001), suggesting a disruption in the one carbon cycle and its methyl donation capability. HFF decreased hepatic choline and betaine (P < 0.0001), which may indicate a compensatory use of the methyl groups of these compounds. The aforementioned reduction of choline used for the CDP-choline pathway and the potential one carbon cycle impact on SAM availability for the phosphatidylethanolamine N-methyltransferase (PEMT) pathway may explain the observed differential changes in hepatic phosphatidylcholines (P < 0.0001), which are required for the production of very low density lipoproteins (VLDL). Unique features of this model such as reduced plasma lipoproteins and lack of weight gain in the presence of hepatic steatosis may be related to an altered one carbon cycle impacting phosphatidylcholine production. ARI, AcornSeekers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,740

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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