MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2982381555 · doi:10.1001/jamapsychiatry.2019.3779

Association of Copy Number Variation of the 15q11.2 BP1-BP2 Region With Cortical and Subcortical Morphology and Cognition

2019· article· en· W2982381555 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJAMA Psychiatry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensUniversity of CalgaryHolland Bloorview Kids Rehabilitation HospitalUniversity of TorontoUniversité de MontréalInstitut Universitaire de Gériatrie de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute for Physiological SciencesNational Institute on AgingSchool of Psychology, Cardiff UniversityNational Institute of Mental HealthHelse Sør-Øst RHFNational Health and Medical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, Los AngelesStiftelsen Kristian Gerhard JebsenNational Institutes of HealthHaukeland UniversitetssjukehusFujita Health UniversityCentro de Investigación Biomédica en Red de Salud MentalRadboud UniversiteitRWTH Aachen UniversityRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnUniversity of Cape TownCommissariat à l'Énergie Atomique et aux Énergies AlternativesInstitute of Psychiatry, Psychology and Neuroscience, King’s College LondonUniversité Paris-SaclayH. Lundbeck A/SCardiff UniversityAkershus UniversitetssykehusDeutsches Zentrum für Neurodegenerative ErkrankungenNational Center of Neurology and PsychiatryUniversitetet i BergenAstellas PharmaVincent Fairfax Family FoundationTechnische Universität DresdenNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringAmsterdam NeuroscienceNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionZonMwQueensland University of TechnologyFondation Brain CanadaGenentechEuropean CommissionNational Institute for Health and Care ResearchKing's College LondonUniversitetet i OsloNorges ForskningsrådAmsterdam University Medical CentersTrinity College DublinNational University of IrelandUniversity of OxfordNeuroscience Research AustraliaUniversity of Southern CaliforniaMax Planck Instituut voor PsycholinguïstiekWellcome TrustRoyal College of Surgeons in IrelandNorges Teknisk-Naturvitenskapelige UniversitetScience Foundation IrelandUniversität BaselMedical Research CouncilUniversity of GalwayBiogen
Mots-clésCopy-number variationCohortNeuroimagingCognitionPopulationBrain sizeEffects of sleep deprivation on cognitive performanceBrain morphometryGene duplicationPsychologyMagnetic resonance imagingGeneticsMedicineNeuroscienceInternal medicineBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Importance: Recurrent microdeletions and duplications in the genomic region 15q11.2 between breakpoints 1 (BP1) and 2 (BP2) are associated with neurodevelopmental disorders. These structural variants are present in 0.5% to 1.0% of the population, making 15q11.2 BP1-BP2 the site of the most prevalent known pathogenic copy number variation (CNV). It is unknown to what extent this CNV influences brain structure and affects cognitive abilities. Objective: To determine the association of the 15q11.2 BP1-BP2 deletion and duplication CNVs with cortical and subcortical brain morphology and cognitive task performance. Design, Setting, and Participants: In this genetic association study, T1-weighted brain magnetic resonance imaging were combined with genetic data from the ENIGMA-CNV consortium and the UK Biobank, with a replication cohort from Iceland. In total, 203 deletion carriers, 45 247 noncarriers, and 306 duplication carriers were included. Data were collected from August 2015 to April 2019, and data were analyzed from September 2018 to September 2019. Main Outcomes and Measures: The associations of the CNV with global and regional measures of surface area and cortical thickness as well as subcortical volumes were investigated, correcting for age, age2, sex, scanner, and intracranial volume. Additionally, measures of cognitive ability were analyzed in the full UK Biobank cohort. Results: Of 45 756 included individuals, the mean (SD) age was 55.8 (18.3) years, and 23 754 (51.9%) were female. Compared with noncarriers, deletion carriers had a lower surface area (Cohen d = -0.41; SE, 0.08; P = 4.9 × 10-8), thicker cortex (Cohen d = 0.36; SE, 0.07; P = 1.3 × 10-7), and a smaller nucleus accumbens (Cohen d = -0.27; SE, 0.07; P = 7.3 × 10-5). There was also a significant negative dose response on cortical thickness (β = -0.24; SE, 0.05; P = 6.8 × 10-7). Regional cortical analyses showed a localization of the effects to the frontal, cingulate, and parietal lobes. Further, cognitive ability was lower for deletion carriers compared with noncarriers on 5 of 7 tasks. Conclusions and Relevance: These findings, from the largest CNV neuroimaging study to date, provide evidence that 15q11.2 BP1-BP2 structural variation is associated with brain morphology and cognition, with deletion carriers being particularly affected. The pattern of results fits with known molecular functions of genes in the 15q11.2 BP1-BP2 region and suggests involvement of these genes in neuronal plasticity. These neurobiological effects likely contribute to the association of this CNV with neurodevelopmental disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,217

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle