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Enregistrement W2982402876 · doi:10.21873/anticanres.11701

Concordance of HER2 Immunohistochemistry and Fluorescence In Situ Hybridization Using Tissue Microarray in Breast Cancer

2017· article· en· W2982402876 sur OpenAlexafffund
Daniela Furrer, Simon Jacob, Chantal Caron, François Sanschagrin, Louise Provencher, Caroline Diorio

Notice bibliographique

RevueAnticancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensHôpital du Saint-SacrementUniversité Laval
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéFondation du cancer du sein du QuébecUniversité Laval
Mots-clésConcordanceImmunohistochemistryTissue microarrayFluorescence in situ hybridizationBreast cancerPathologyIn situ hybridizationMedicineCancerBiologyOncologyInternal medicineGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: Immunohistochemistry (IHC) and fluorescence in situ hybridization (FISH) are common methods for assessment of human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) in breast cancer. MATERIALS AND METHODS: In a cohort of 498 consecutive patients with breast cancer, we examined concordance between IHC and FISH for HER2 on tissue microarray (TMA) sections. In a subset of 116 specimens, we examined HER2 concordance from the block used for diagnostics and a randomly-chosen additional block (a proxy of the core biopsy). RESULTS: Overall concordance between both methods on TMA sections was 93.8% and between HER2, determined on diagnostic and additional blocks, was 93.6% for IHC and 98.0% for FISH. CONCLUSION: Since some cases were discordant, we suggest that both methods be used for HER2 assessment. The lower concordance rate between diagnostic and additional blocks using IHC compared to FISH suggests a greater variability of IHC staining across tumor regions than for FISH results.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,081
Tête enseignante GPT0,487
Écart entre enseignants0,405 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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