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Enregistrement W2982503058 · doi:10.1094/pbiomes-04-19-0021-r

Root Endophytes of Coffee (<i>Coffea</i> <i>arabica</i>): Variation Across Climatic Gradients and Relationships with Functional Traits

2019· article· en· W2982503058 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePhytobiomes Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhyllosphereBotanyMicrobiomeCoffea arabicaTerminal restriction fragment length polymorphismEcologyRestriction fragment length polymorphismBacteriaPolymerase chain reaction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The root microbiome of Central American coffee trees was studied from four different sites experiencing different annual temperatures and precipitation levels, sampling from plots grown conventionally and under agroforestry management (with shade trees). Total community DNA was separately extracted from roots from four trees sampled from each site/management pair and analyzed using terminal restriction fragment polymorphism analysis and also next generation sequencing (Illumina) of fungal and bacterial ribosomal amplicons. Community profiles were analyzed for site and management effects and correlations to environmental parameters and tree leaf and root economic traits. Communities of both bacteria and fungi varied with site locations, but were not impacted by management system type. They also both varied strongly with environmental parameters. Fungal communities also showed significant variation that could be attributed to plant leaf and root traits. Pooled DNA samples from each site/management regime were used to generate amplicons for next generation sequencing to determine the dominant members of the coffee root microbiome at these locations. Core bacterial genera included Pantoea, Enterobacter, and Burkholderia, while fungal core communities were dominated by members of Cladosporium, Penicillium, Exidiopsis, Trechispora, and Mycena. The potential ecological function of these microbial associates is discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,738
Score d'incertitude au seuil0,302

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle