Quantification of Cytokinins Using High-Resolution Accurate-Mass Orbitrap Mass Spectrometry and Parallel Reaction Monitoring (PRM)
Notice bibliographique
Résumé
Cytokinins (CKs) are adenine derivatives that act as phytohormones. These signaling molecules control plant cell division and differentiation, organ growth, and senescence, and they orchestrate plant interactions with biotic and abiotic environments. While CKs are predominately recognized as plant-based substances, CKs have been found across different domains of life, including microorganisms, insects, mammals, and humans. In plants, CKs act at trace, often low femtomolar concentrations; therefore, sensitive and precise analytical techniques are required to accurately detect and quantify them from complex biological matrices. Here, we report the first comprehensive CK quantification method using a QExactive Orbitrap mass spectrometer in high-resolution with a parallel reaction monitoring (PRM)-based approach. The current method progresses upon multiple reaction monitoring (MRM) methods, previously used for CK profiling on triple quadrupole mass spectrometers. This method offers improved mass accuracy and the complete product ion mass spectra (MS/MS) for compound determination with increased specificity, and sensitivity comparable with triple quadrupole instruments. The presented PRM approach was successfully applied to quantify 32 CKs in several biological samples.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».