MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2982564486 · doi:10.3390/fermentation5040093

The Use of CRISPR-Cas9 Genome Editing to Determine the Importance of Glycerol Uptake in Wine Yeast During Icewine Fermentation

2019· article· en· W2982564486 sur OpenAlexafffund
Jared Muysson, Laurianne Miller, Robert Allie, Debra Inglis

Notice bibliographique

RevueFermentation · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGlycerolFermentationYeastSaccharomyces cerevisiaeOsmotic shockBiochemistryCRISPRStrain (injury)Cas9Osmotic concentrationChemistryYeast in winemakingAcetic acidFood scienceFermentation in winemakingBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The high concentration of sugars in Icewine juice causes formidable stress for the fermenting Saccharomyces cerevisiae, causing cells to lose water and shrink in size. Yeast can combat this stress by increasing the internal concentration of glycerol by activating the high osmolarity glycerol response to synthesize glycerol and by actively transporting glycerol into the cell from the environment. The H+/glycerol symporter, Stl1p, has been previously characterized as being glucose repressed and inactivated, despite osmotic stress induction. To further investigate the role of Stl1p in Icewine fermentations, we developed a rapid single plasmid CRISPR-Cas9-based genome editing method to construct a strain of the common Icewine yeast, S. cerevisiae K1-V1116, that lacks STL1. In an Icewine fermentation, the ∆STL1 strain had reduced fermentation performance, and elevated glycerol and acetic acid production compared to the parent. These results demonstrate that glycerol uptake by Stl1p has a significant role during osmotically challenging Icewine fermentations in K1-V1116 despite potential glucose downregulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFermentationMême sujetMicrobial Metabolic Engineering and BioproductionTravaux en français237 207