Recognition of Lewis X by Anti-Lex Monoclonal Antibody 1G5F6
Notice bibliographique
Résumé
Abstract mAbs directed toward the Lewis X (Lex) determinant have been shown to display different specificities, depending on the presentation of Lex to the immune system. Of interest is the murine anti-Lex mAb 1G5F6, generated against the O chain polysaccharide of Helicobacter pylori that contains polymeric Lex structures. The mAb was found to have a higher affinity for polymeric Lex over monomeric Lex. In this study, we explore the recognition of monomeric Lex by 1G5F6 using a panel of Lex analogues in which N-acetyl-d-glucosamine, l-fucose, or d-galactose (d-Gal) are replaced with d-glucose and/or l-rhamnose. Our studies show that all analogues were weaker inhibitors than the Lex Ag, indicating that all three residues are essential in the recognition of Lex by mAb 1G5F6. We explored the involvement of 4″-OH of d-Gal in the binding with 1G5F6 using a panel of 4″-modified Lex analogues. Although the 4″-OH is only involved in a weak polar interaction, we conclude that the d-Gal residue in Lex is primarily involved in aromatic stacking interactions with the Ab binding site. We compared these results to our work with mAb SH1. Although stacking interactions between d-Gal and an aromatic residue was also suggested for SH1, an H-bond involving the 4″-OH was identified that is not found in the binding of 1G5F6 to Lex. Thus, anti-Lex mAbs SH1 and 1G5F6 bind to Lex in different manners, even though the hydrophobic patch displayed by the β-galactoside in Lex is essential in both cases for their binding to Lex.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».