An onboard checking mechanism ensures effector delivery of the type VI secretion system in <i>Vibrio cholerae</i>
Notice bibliographique
Résumé
effectors, TseL, VasX, and VgrG3, we show that the physical presence but not their activities is crucial for T6SS assembly. We constructed catalytic mutants of TseL and VgrG3 and truncated VasX mutants. These mutations abolished the killing of the effector-cognate immunity mutants. We determined that the VasX-mediated antimicrobial activity is solely dependent on the C-terminal colicin domain. Removal of the colicin domain abolished VasX secretion and reduced T6SS assembly, while deletion of the colicin internal loop abolished its toxicity but had little effect on secretion and assembly. The triple effector-inactive mutant maintains an active T6SS that is capable of delivering chimeric VgrG, PAAR, and TseL proteins fused with a cargo nuclease, indicating effector activities are not required for T6SS assembly or penetration into the cytosol of recipient cells. Therefore, by recruiting effectors as critical components for T6SS assembly, it represents an effective onboard checking mechanism that ensures effectors are loaded in place to prevent futile secretion. Our study also demonstrates a detoxified secretion platform by inactivating native effector activities that could translocate engineered cargo proteins via multiple routes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».