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Enregistrement W2982652283 · doi:10.1073/pnas.1914202116

An onboard checking mechanism ensures effector delivery of the type VI secretion system in <i>Vibrio cholerae</i>

2019· article· en· W2982652283 sur OpenAlexafffund
Xiaoye Liang, Fatima Kamal, Tong‐Tong Pei, Ping Xu, John J. Mekalanos, Tao Dong

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Natural Science Foundation of ChinaGovernment of Canada
Mots-clésVibrio choleraeEffectorSecretionMechanism (biology)Type three secretion systemType (biology)Cholera toxinBiologyMicrobiologyComputer scienceCell biologyVirulencePhysicsBacteriaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

effectors, TseL, VasX, and VgrG3, we show that the physical presence but not their activities is crucial for T6SS assembly. We constructed catalytic mutants of TseL and VgrG3 and truncated VasX mutants. These mutations abolished the killing of the effector-cognate immunity mutants. We determined that the VasX-mediated antimicrobial activity is solely dependent on the C-terminal colicin domain. Removal of the colicin domain abolished VasX secretion and reduced T6SS assembly, while deletion of the colicin internal loop abolished its toxicity but had little effect on secretion and assembly. The triple effector-inactive mutant maintains an active T6SS that is capable of delivering chimeric VgrG, PAAR, and TseL proteins fused with a cargo nuclease, indicating effector activities are not required for T6SS assembly or penetration into the cytosol of recipient cells. Therefore, by recruiting effectors as critical components for T6SS assembly, it represents an effective onboard checking mechanism that ensures effectors are loaded in place to prevent futile secretion. Our study also demonstrates a detoxified secretion platform by inactivating native effector activities that could translocate engineered cargo proteins via multiple routes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,114
Score d'incertitude au seuil0,184

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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