Author response: Evaluating probabilistic dengue risk forecasts from a prototype early warning system for Brazil
Notice bibliographique
Résumé
Dengue is a viral infection spread by mosquitoes and is widespread in tropical and sub-tropical regions. Dengue epidemics in Brazil often occur without warning, and can overwhelm the public health services. Forecasts of seasonal climates combined with early data from a dengue surveillance system could help public health services anticipate dengue outbreaks several months in advance. However, this information has not been previously exploited to predict dengue epidemics in a practical real-life framework. Recently, a group of researchers developed a prototype of a dengue early warning system based on 13 years worth of data, and used it to predict the risk of dengue three months ahead of the 2014 FIFA World Cup in Brazil. Now Lowe et al. – including most of the researchers involved in the earlier work – have evaluated the prototype against the actual reported cases of dengue during the event. Brazil is divided into over 550 'microregions', and the forecasts correctly predicted high risk of dengue for 57% of the microregions reporting high levels of dengue during the games. Forecasts based on seasonal dengue averages would have only detected high risk in 33% of these microregions. The forecasts also correctly predicted the dengue risk level in seven out of the twelve cities where the World Cup games were hosted. However, the prototype failed to predict the high risk in both São Paulo and Brasília. Lowe et al. speculate that this may have been due to changes in how water was stored in these cities (standing water is a breeding site for mosquitoes) and the circulation of a new strain of the dengue virus. The implementation of seasonal climate forecasts and early reports of dengue cases into an early warning system is now a priority for public health authorities. This action is likely to help them to prepare for and minimize epidemics of dengue and other diseases that are spread by mosquitoes, such as chikungunya and Zika virus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,032 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».