MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2982988000 · doi:10.1016/j.mex.2019.10.024

An efficient and affordable laboratory method to produce and sustain high concentrations of microcystins by Microcystis aeruginosa

2019· article· en· W2982988000 sur OpenAlexafffund
René S. Shahmohamadloo, Xavier Ortiz Almirall, Claire Holeton, Richard Chong-Kit, David G. Poirier, Satyendra P. Bhavsar, Paul K. Sibley

Notice bibliographique

RevueMethodsX · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Ecosystems and Phytoplankton Dynamics
Établissements canadiensUniversity of TorontoQueen's UniversityMinistry of the Environment, Conservation and ParksUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésMicrocystis aeruginosaMicrocystisMicrocystinCyanobacteriaEnvironmental chemistryNational laboratoryEnvironmental scienceBiologyChemistryEngineeringBacteriaEngineering physics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microcystis aeruginosa is a cosmopolitan cyanobacteria that continues to jeopardize freshwater ecosystem services by releasing the hepatotoxin microcystin, which can, in some cases, cause death to aquatic fauna and even humans. Currently, our abilities to understand the mechanisms of microcystin toxicology are limited by the lack of a method for producing high concentrations, which are central to large-scale and long-term research in natural systems. Here we present an efficient and affordable laboratory method to produce high concentrations of microcystins by a toxigenic strain of M. aeruginosa . Through batch culture studies, we yielded microcystins at concentrations that are environmentally relevant to freshwaters around the world (1–300 μg L −1 ), maintained these concentrations without resupplying fresh medium (further reducing costs), and utilized rate equations to model the relationship between the environmental conditions in the cultures and changes occurring within the M. aeruginosa cells. Our assessment suggests that steady production of microcystins depends on the availability of carbon throughout the experiment. Hence, we recommend the use of tissue culture treated flasks with a vented cap to ensure the production of microcystins is uninterrupted. This method demonstrates that microcystins can be produced in the laboratory at concentrations relevant to freshwater ecosystems. •The method demonstrates M. aeruginosa CPCC 300 is a reliable strain of freshwater cyanobacteria that can yield microcystins at environmentally relevant concentrations. •Validation showed M. aeruginosa CPCC 300 is resilient in carbon-limited situations and may respond to stress by shifting the ratio of microcystin congeners. •Cell culture flasks with vented caps —filled no more than 50 % of the flask volume to allow for sufficient air exchange— are an excellent and cost-effective approach to maintaining cell growth and producing microcystins at a range between 300 to 1200 μg L −1 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMethodsXMême sujetAquatic Ecosystems and Phytoplankton DynamicsTravaux en français237 207