STYK1 promotes autophagy through enhancing the assembly of autophagy-specific class III phosphatidylinositol 3-kinase complex I
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Notice bibliographique
Résumé
Macroautophagy/autophagy plays key roles in development, oncogenesis, and cardiovascular and metabolic diseases. Autophagy-specific class III phosphatidylinositol 3-kinase complex I (PtdIns3K-C1) is essential for autophagosome formation. However, the regulation of this complex formation requires further investigation. Here, we discovered that STYK1 (serine/threonine/tyrosine kinase 1), a member of the receptor tyrosine kinases (RTKs) family, is a new upstream regulator of autophagy. We discovered that STYK1 facilitated autophagosome formation in human cells and zebrafish, which was characterized by elevated LC3-II and lowered SQSTM1/p62 levels and increased puncta formation by several marker proteins, such as ATG14, WIPI1, and ZFYVE1. Moreover, we observed that STYK1 directly binds to the PtdIns3K-C1 complex as a homodimer. The binding with this complex was promoted by Tyr191 phosphorylation, by means of which the kinase activity of STYK1 was elevated. We also demonstrated that STYK1 elevated the serine phosphorylation of BECN1, thereby decreasing the interaction between BECN1 and BCL2. Furthermore, we found that STYK1 preferentially facilitated the assembly of the PtdIns3K-C1 complex and was required for PtdIns3K-C1 complex kinase activity. Taken together, our findings provide new insights into autophagy induction and reveal evidence of novel crosstalk between the components of RTK signaling and autophagy.Abbreviations: AICAR: 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide; AMPK: adenosine 5‘-monophosphate (AMP)-activated protein kinase; ATG: autophagy related; ATP: adenosine triphosphate; BCL2: BCL2 apoptosis regulator; BECN1: beclin 1; Bre A: brefeldin A; Co-IP: co-immunoprecipitation; CRISPR: clustered regularly interspaced short palindromic repeats; DAPI: 4′,6-diamidino-2-phenylindole; EBSS: Earle’s balanced salt solution; GAPDH: glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; GFP: green fluorescent protein; GSEA: gene set enrichment analysis; MAP1LC3/LC3, microtubule associated protein 1 light chain 3; MAPK8/JNK1: mitogen-activated protein kinase 8; mRFP: monomeric red fluorescent protein; MTOR: mechanistic target of rapamycin kinase; MTT: 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2, 5-diphenyltetrazolium bromide; PIK3C3: phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3; PIK3R4: phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4; qRT-PCR: quantitative reverse transcription PCR; RACK1: receptor for activated C kinase 1; RUBCN: rubicon autophagy regulator; siRNA: small interfering RNA; SQSTM1: sequestosome 1; STYK1/NOK: serine/threonine/tyrosine kinase 1; TCGA: The Cancer Genome Atlas; Ub: ubiquitin; ULK1: unc-51 like autophagy activating kinase 1; UVRAG: UV radiation resistance associated; WIPI1: WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1; ZFYVE1: zinc finger FYVE-type containing 1
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle