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Enregistrement W2983138826 · doi:10.1002/cyto.b.21854

Common flow cytometry pitfalls in diagnostic hematopathology

2019· review· en· W2983138826 sur OpenAlexaff
Sindhu Cherian, Ben Hedley, Michael Keeney

Notice bibliographique

RevueCytometry Part B Clinical Cytometry · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensLondon Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHematopathologyComputer scienceIdentification (biology)PopulationInterpretation (philosophy)Medical physicsMedicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Flow cytometry (FC) has proven to be an extremely versatile and useful tool in the diagnosis and monitoring of hematological diseases in addition to numerous other applications. Major advances in electronics, software, and reagents over the past years have simplified some aspects of FC, while at the same time the ability to combine 8-10 antibodies in a single tube can create both technical and interpretation issues that are more difficult to detect when using only 3-4 color combinations. Use of multiparameter panels can facilitate identification of abnormal populations; however, characteristics of the neoplastic population may create potential diagnostic pitfalls. An understanding of normal immunophenotypic patterns in states of rest, recovery, and activation is a critical first step in order to appropriately identify the abnormal populations that characterize hematopoietic neoplasms. Additionally, incorporation of newer therapeutic strategies, in particular targeted therapies, can confound standard methods for flow cytometric data analysis and knowledge of the impact of therapy on flow cytometric data is critical for accurate data interpretation. This manuscript will review preanalytical, instrument, and interpretation issues that may lead to incorrect interpretation of results.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0040,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,411
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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