A tale of worldwide success: Behind the scenes of <i>Carex</i> (Cyperaceae) biogeography and diversification
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The megadiverse genus Carex (c. 2000 species, Cyperaceae) has a nearly cosmopolitan distribution, displaying an inverted latitudinal richness gradient with higher species diversity in cold‐temperate areas of the Northern Hemisphere. Despite great expansion in our knowledge of the phylogenetic history of the genus and many molecular studies focusing on the biogeography of particular groups during the last few decades, a global analysis of Carex biogeography and diversification is still lacking. For this purpose, we built the hitherto most comprehensive Carex‐ dated phylogeny based on three markers (ETS–ITS– matK ), using a previous phylogenomic Hyb‐Seq framework, and a sampling of two‐thirds of its species and all recognized sections. Ancestral area reconstruction, biogeographic stochastic mapping, and diversification rate analyses were conducted to elucidate macroevolutionary biogeographic and diversification patterns. Our results reveal that Carex originated in the late Eocene in E Asia, where it probably remained until the synchronous diversification of its main subgeneric lineages during the late Oligocene. E Asia is supported as the cradle of Carex diversification, as well as a “museum” of extant species diversity. Subsequent “out‐of‐Asia” colonization patterns feature multiple asymmetric dispersals clustered toward present times among the Northern Hemisphere regions, with major regions acting both as source and sink (especially Asia and North America), as well as several independent colonization events of the Southern Hemisphere. We detected 13 notable diversification rate shifts during the last 10 My, including remarkable radiations in North America and New Zealand, which occurred concurrently with the late Neogene global cooling, which suggests that diversification involved the colonization of new areas and expansion into novel areas of niche space.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».