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TRY plant trait database – enhanced coverage and open access
Jens Kattge, Gerhard Bönisch, Sandra Dı́az, Sandra Lavorel, I. Colin Prentice, Paul Leadley, Susanne Tautenhahn, Gijsbert D. A. Werner, Tuomas Aakala, Mehdi Abedi, Alicia Teresa Rosario Acosta, George C. Adamidis, Kairi Adamson, Masahiro Aiba, Cécile H. Albert, Julio M. Alcántara, Carolina Alcázar C, Izabela Aleixo, Hamada E. Ali, Bernard Amiaud, Christian Ammer, Mariano M. Amoroso, Madhur Anand, C. Anderson, Niels P. R. Anten, Joseph A. Antos, Deborah M. G. Apgaua, Tia‐Lynn Ashman, Degi Harja Asmara, Gregory P. Asner, Michael J. Aspinwall, Owen K. Atkin, Isabelle Aubin, Lars Baastrup‐Spohr, Khadijeh Bahalkeh, Michael Bahn, Timothy R. Baker, William J. Baker, Jan P. Bakker, Dennis Baldocchi, Jennifer L. Baltzer, Arindam Banerjee, Anne Baranger, Jos Barlow, Diego R. Barneche, Zdravko Baruch, Denis Bastianelli, John J. Battles, William L. Bauerle, Marijn Bauters, Erika Bazzato, Michael Beckmann, Hans Beeckman, Carl Beierkuhnlein, Renée M. Bekker, Gavin Belfry, Michaël Belluau, Mirela Beloiu, Raquel Benavides, Lahcen Benomar, Mary Lee Berdugo‐Lattke, Erika Berenguer, Rodrigo Scarton Bergamin, Joana Bergmann, Marcos Bergmann Carlucci, Logan T. Berner, Markus Bernhardt‐Römermann, Christof Bigler, Anne D. Bjorkman, Chris J. Blackman, C. Blanco, Benjamin Blonder, Dana M. Blumenthal, Kelly T. Bocanegra‐González, Pascal Boeckx, Stephanie Bohlman, Katrin Böhning‐Gaese, Laura Boisvert‐Marsh, William J. Bond, Ben Bond‐Lamberty, Arnoud Boom, Coline C. F. Boonman, Kauane Maiara Bordin, Elizabeth H. Boughton, Vanessa Boukili, David M. J. S. Bowman, Sandra Bravo, Marco R. Brendel, Martin R. Broadley, Kerry A. Brown, Helge Bruelheide, Federico Brumnich, Hans Henrik Bruun, David Bruy, Serra-Willow Buchanan, Solveig Franziska Bucher, Nina Buchmann, Robert Buitenwerf, Daniel E. Bunker, Jana Bürger, Sabina Burrascano, David F. R. P. Burslem, Bradley J. Butterfield, Chaeho Byun, Márcia C. M. Marques, Marina Corrêa Scalon, Marco Caccianiga, Marc W. Cadotte, Maxime Cailleret, James Camac, J. Julio Camarero, Courtney Campany, Giandiego Campetella, Juan Antonio Campos, Laura V. Cano-Arboleda, Roberto Canullo, Michele Carbognani, Fábio Carvalho, Fernando Casanoves, Bastien Castagneyrol, Jane A. Catford, Jeannine Cavender‐Bares, Bruno Enrico Leone Cerabolini, Marco Cervellini, Eduardo Chacón‐Madrigal, Kenneth James Chapin, F. Stuart Chapin, Stefano Chelli, Si‐Chong Chen, Anping Chen, Paolo Cherubini, Francesco Chianucci, Brendan Choat, Kyong‐Sook Chung, Milan Chytrý, Daniela Ciccarelli, Lluís Coll, Courtney G. Collins, Luisa Conti, David A. Coomes, Johannes H. C. Cornelissen, William K. Cornwell, Piermaria Corona, Marie R. Coyea, Joseph M. Craine, Dylan Craven, Joris P. G. M. Cromsigt, Anikó Csecserits, Katarina Čufar, Matthias Cuntz, Ana Carolina da Silva, Kyla M. Dahlin, Matteo Dainese, I. V. Dalke, Michele Dalle Fratte, Anh Tuan Dang‐Le, Jiří Danihelka, Masako Dannoura, Samantha K. Dawson, Arend Jacobus de Beer, Ángel de Frutos, Jonathan R. De Long, Benjamin Dechant, Sylvain Delagrange, Nicolas Delpierre, Géraldine Derroire, Arildo S. Dias, Milton H. Díaz‐Toribio, Panayiotis G. Dimitrakopoulos, Mark P. Dobrowolski, Daniel Doktor, Pavel Dřevojan, Ning Dong, John Dransfield, Stefan Dreßler, Leandro Duarte, Émilie Ducouret, Stefan Dullinger, Walter Durka, Remko A. Duursma, О. В. Дымова, Anna E‐Vojtkó, R. Lutz Eckstein, Hamid Ejtehadi, James J. Elser, Thaíse Emilio, Kristine Engemann, Mohammad Bagher Erfanian, Alexandra Erfmeier, Adriane Esquivel‐Muelbert, G. Esser, Marc Estiarte, Tomas F. Domingues, William F. Fagan, Jaime Fagúndez, Daniel S. Falster, Ying Fan, Jingyun Fang, Emmanuele Farris, Fatih Fazlioglu, Yanhao Feng, Fernando Fernández‐Méndez, Carlotta Ferrara, Joice Ferreira, Alessandra Fidélis, Bryan Finegan, Jennifer Firn, T. J. Flowers, Dan F. B. Flynn, Veronika Fontana, Estelle Forey, Cristiane Forgiarini, Louis François, Marcelo Araújo Frangipani, Dorothea Frank, Cédric Frenette‐Dussault, Grégoire T. Freschet, Ellen L. Fry, Nikolaos M. Fyllas, Guilherme G. Mazzochini, Sophie Gachet, Rachael V. Gallagher, Gislene Ganade, Francesca Ganga, Pablo García‐Palacios, Veronica Beatriz Gargaglione, Éric Garnier, José Luis Hernando Garrido, André Luís de Gasper, Guillermo Gea‐Izquierdo, David J. Gibson, Andrew N. Gillison, Aelton Biasi Giroldo, Mary‐Claire Glasenhardt, Sean M. Gleason, Mariana Gliesch, Emma E. Goldberg, Bastian Göldel, Erika Gonzalez‐Akre, José Luis González Andújar, Andrés González‐Melo, Ana González‐Robles, Bente J. Graae, Elena Granda, Sarah Graves, Walton A. Green, Thomas Gregor, Nicolas Gross, Greg R. Guerin, Angela Günther, Álvaro G. Gutiérrez, Lillie Haddock, A. K. Haines, Jefferson S. Hall, Alain Hambuckers, Wenxuan Han, Sandy P. Harrison, Wesley Hattingh, Joseph E. Hawes, Tianhua He, Pengcheng He, J. Mason Heberling, Aveliina Helm, Stefan Hempel, Jörn Hentschel, Bruno Hérault, Ana‐Maria Hereş, Katharina Herz, Myriam Heuertz, Thomas Hickler, Peter Hietz, Pedro Higuchi, Andrew L. Hipp, Andrew D. Hirons, Maria Hock, J. Aaron Hogan, Karen D. Holl, Olivier Honnay, Daniel Hornstein, Enqing Hou, Nate Hough‐Snee, Knut Anders Hovstad, Tomoaki Ichie, Boris Igić, Estela Illa, Marney E. Isaac, Masae I. Ishihara, Л. А. Иванов, Л. А. Иванова, Colleen M. Iversen, Jordi Izquierdo, Robert B. Jackson, Benjamin G. Jackson, Hervé Jactel, Andrzej M. Jagodziński, Ute Jandt, Steven Jansen, Thomas F. Jenkins, Anke Jentsch, J. Rasmus P. Jespersen, Guo‐Feng Jiang, Jesper Liengaard Johansen, David Johnson, Eric J. Jokela, Carlos Alfredo Joly, Gregory J. Jordan, Grant S. Joseph, Decky Indrawan Junaedi, Robert R. Junker, Éric Justes, Richard Kabzems, Jeffrey M. Kane, Zdeněk Kaplan, Teja Kattenborn, Lyudmila Mikhailovna Kavelenova, Elizabeth Kearsley, Anne Kempel, Tanaka Kenzo, Andrew J. Kerkhoff, Mohammed I. Khalil, Nicole L. Kinlock, W. Daniel Kissling, Kaoru Kitajima, Thomas Kitzberger, Rasmus Kjøller, Tamir Klein, Michael Kleyer, Jitka Klimešová, Joice Klipel, Brian D. Kloeppel, Stefan Klotz, Johannes M. H. Knops, Takashi Kohyama, Fumito Koike, Johannes Kollmann, Benjamín Komac, Kimberly J. Komatsu, Christian König, Nathan J. B. Kraft, K. Krämer, Holger Kreft, Ingolf Kühn, Dushan Kumarathunge, Jonas Kuppler, Hiroko Kurokawa, Yoko Kurosawa, Shem Kuyah, Jean‐Paul Laclau, Benoît Lafleur, Erik Lallai, Eric G. Lamb, Andrea Lamprecht, Daniel J. Larkin, Daniel C. Laughlin, Yoann Le Bagousse‐Pinguet, Guerric Le Maire, Peter C. le Roux, Elizabeth le Roux, Tali D. Lee, Frederic Lens, Simon L. Lewis, Barbara Lhotsky, Yuanzhi Li, Xine Li, Jeremy W. Lichstein, Mario Liebergesell, Jun Ying Lim, Yan‐Shih Lin, Juan Carlos Linares, Chunjiang Liu, Daijun Liu, Udayangani Liu, Stuart W. Livingstone, Joan Llusià, Madelon Lohbeck, Álvaro López‐García, Gabriela López‐González, Zdeňka Lososová, Frédérique Louault, Balázs Lukács, Petr Lukeš, Yunjian Luo, Michele Lussu, Siyan Ma, Camilla Maciel Rabelo Pereira, Michelle C. Mack, Vincent Maire, Annikki Mäkelä, Harri Mäkinen, Ana C. M. Malhado, Azim U. Mallik, Peter Manning, Stefano Manzoni, Zuleica Yael Marchetti, Luca Marchino, Vinícius Marcilio‐Silva, Éric Marcon, Michela Marignani, Lars Markesteijn, Adam R. Martin, Cristina Martínez‐Garza, Jordi Martínez‐Vilalta, Tereza Mašková, Kelly E. Mason, Norman W. H. Mason, Tara Joy Massad, Jacynthe Masse, Itay Mayrose, James K. McCarthy, Michael McCormack, Katherine A. McCulloh, Ian R. McFadden, Brian J. McGill, Mara Y. McPartland, Juliana S. Medeiros, Belinda E. Medlyn, Pierre Meerts, Zia Mehrabi, Patrick Meir, Felipe P. L. Melo, Maurizio Mencuccini, Céline Meredieu, Julie Messier, Ilona Mészáros, Juha M. Metsaranta, Sean T. Michaletz, Chrysanthi Michelaki, С. В. Мигалина, Rubén Milla, Jesse E. D. Miller, Vanessa Minden, Ray Ming, Karel Mokany, Angela T. Moles, Attila Molnár V., Jane Molofsky, Martin Molz, Rebecca Montgomery, Arnaud Monty, Lenka Moravcová, Álvaro Moreno‐Martínez, Marco Moretti, Akira Mori, Shigeta Mori, Dave Morris, Jane Morrison, Ladislav Mucina, Sandra Müeller, Christopher D. Muir, Sandra Cristina Müller, François Munoz, Isla H. Myers‐Smith, Randall W. Myster, Masahiro Nagano, Shawna L. Naidu, Narayanan Ayyappan, Natesan Balachandran, Luka Negoita, Andrew S. Nelson, Eike Lena Neuschulz, Jian Ni, Georg Niedrist, Jhon Nieto, Ülo Niinemets, Rachael H. Nolan, Henning Nottebrock, Yann Nouvellon, Alexander Novakovskiy, Kristin Odden Nystuen, Anthony P. O’Grady, Kevin L. O’Hara, Andrew O’Reilly‐Nugent, Simon Oakley, Walter Oberhuber, Toshiyuki Ohtsuka, Ricardo A. C. de Oliveira, Kinga Öllerer, Mark E. Olson, V. G. Onipchenko, Yusuke Onoda, Renske E. Onstein, Jenny Ordóñez, Noriyuki Osada, Ivika Ostonen, Gianluigi Ottaviani, Sarah P. Otto, Gerhard E. Overbeck, W.A. Ozinga, Anna T. Pahl, C. E. Timothy Paine, Robin J. Pakeman, Aristotelis C. Papageorgiou, Evgeniya Parfionova, Meelis Pärtel, Marco Patacca, Susana Paula, Juraj Paule, Harald Pauli, Juli G. Pausas, Begoña Peco, Josep Peñuelas, Antonio J. Perea, Pablo L. Peri, Ana Carolina Petisco‐Souza, Alessandro Petraglia, Any Mary Petriţan, Oliver L. Phillips, Simon Pierce, Valério D. Pillar, Jan Písek, Alexandr Pomogaybin, Hendrik Poorter, Angelika Portsmuth, Peter Poschlod, Catherine Potvin, Devon Pounds, A. Shafer Powell, Sally A. Power, Andreas Prinzing, Giacomo Puglielli, Petr Pyšek, Valérie Raevel, Anja Rammig, Johannes Ransijn, Courtenay A. Ray, Peter B. Reich, Markus Reichstein, Douglas E.B. Reid, Maxime Réjou‐Méchain, Víctor Resco de Dios, Sabina Cerruto Ribeiro, Sarah J. Richardson, Kersti Riibak, Matthias C. Rillig, Fiamma Riviera, Elisabeth M. R. Robert, Scott D. Roberts, Bjorn J. M. Robroek, Adam B. Roddy, Arthur Vinícius Rodrigues, Alistair Rogers, Emily Rollinson, Víctor Rolo, Christine Römermann, Д. А. Ронжина, Christiane Roscher, Julieta A. Rosell, Milena Fermina Rosenfield, Christian Rossi, David B. Roy, Samuel Royer‐Tardif, Nadja Rüger, Ricardo Ruíz‐Peinado, Sabine B. Rumpf, Masahiro Ryo, Lawren Sack, Angela Saldaña, Beatriz Salgado‐Negret, Roberto Salguero‐Gómez, Ana Carolina Santacruz‐García, Joaquim Santos, Jordi Sardans, Brandon S. Schamp, Michael Scherer‐Lorenzen, Matthias Schleuning, Bernhard Schmid, Marco Schmidt, Sylvain Schmitt, Julio V. Schneider, Simon D. Schowanek, Julian Schrader, Franziska Schrodt, Bernhard Schuldt, Frank M. Schurr, Galia Selaya Garvizu, Marina Semchenko, Colleen L. Seymour, Júlia Caram Sfair, Joanne M. Sharpe, Christine S. Sheppard, Serge Sheremetiev, Satomi Shiodera, Bill Shipley, Tanvir Ahmed Shovon, Alrun Siebenkäs, Carlos A. Sierra, Vasco Silva, Mateus Silva, Tommaso Sitzia, Henrik Sjöman, Martijn Slot, Nicholas G. Smith, Darwin S. Sodhi, Pamela S. Soltis, Douglas E. Soltis, Ben Somers, Grégory Sonnier, Mia Vedel Sørensen, Ênio Sosinski, Nadejda A. Soudzilovskaia, Alexandre F. Souza, Marko J. Spasojevic, Marta Gaia Sperandii, Amanda B. Stan, James Stegen, Klaus Steinbauer, Jörg G. Stephan, Frank J. Sterck, Dejan Stojanović, Tanya Strydom, María Laura Suárez, Jens‐Christian Svenning, Ivana Svitková, Marek Svitok, Miroslav Svoboda, Emily K. Swaine, Nathan G. Swenson, Marcelo Tabarelli, Kentaro Takagi, Ulrike Tappeiner, Rubén Tarifa, Simon Tauugourdeau, Çağatay Tavşanoğlu, Mariska te Beest, Leho Tedersoo, Nelson Thiffault, Dominik Thom, Evert Thomas, Ken Thompson, Peter Thornton, Wilfried Thuiller, Lubomír Tichý, David T. Tissue, Mark G. Tjoelker, David Y. P. Tng, Joseph A. Tobias, Péter Török, Tonantzin Tarín, José Manuel Torres Ruiz, Béla Tóthmérész, Martina Treurnicht, Valeria Trivellone, Franck Trolliet, Volodymyr Trotsiuk, James L. Tsakalos, Ioannis Tsiripidis, Niklas Tysklind, Toru Umehara, V. А. Usoltsev, Matthew A. Vadeboncoeur, Jamil Vaezi, Fernando Valladares, Jana C. Vamosi, Peter M. van Bodegom, Michiel van Breugel, Elisa Van Cleemput, Martine van de Weg, Stephni van der Merwe, Fons van der Plas, Masha T. van der Sande, Mark van Kleunen, Koenraad Van Meerbeek, Mark C. Vanderwel, Kim André Vanselow, Angelica Vårhammar, Laura Varone, Maribel Vásquez‐Valderrama, Kiril Vassilev, Mark Vellend, Erik J. Veneklaas, Hans Verbeeck, Kris Verheyen, Alexander Christian Vibrans, Ima Célia Guimarães Vieira, Jaime Villacís, Cyrille Violle, Vivek Pandi, Katrin Wagner, Matthew Waldram, Anthony Waldron, Anthony P. Walker, Martyn Waller, Gabriel Walther, Han Wang, Feng Wang, Weiqi Wang, Harry Watkins, James E. Watkins, Ulrich Weber, James T. Weedon, Liping Wei, Patrick Weigelt, Evan Weiher, Aidan W. Wells, Camilla Wellstein, Elizabeth Wenk, Mark Westoby, Alana R. Westwood, Philip J. White, Mark Whitten, Mathew Williams, Daniel E. Winkler, Klaus Winter, Chevonne Womack, Ian J. Wright, S. Joseph Wright, Justin P. Wright, Bruno X. Pinho, Fabiano Ximenes, Toshihiro Yamada, Keiko Yamaji, Ruth D. Yanai, Nikolay Viktorovich Yankov, Benjamin Yguel, Kátia Janaína Zanini, Amy E. Zanne, David Zelený, Yunpeng Zhao, Jingming Zheng, Ji Zheng, Kasia Ziemińska, Chad R. Zirbel, Georg Zizka, Irié C. Zo‐Bi, Gerhard Zotz, Christian Wirth
Notice bibliographique
RevueGlobal Change Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBanana Cultivation and Research
Établissements canadiensUniversity of WinnipegUniversity of CalgaryUniversity of ReginaMcGill UniversityLakehead UniversityUniversité du Québec en Abitibi-TémiscamingueMinistry of ForestsUniversity of TorontoUniversité du Québec à MontréalUniversité de SherbrookeAlgoma UniversityUniversité du Québec en OutaouaisCentre de Géomatique du QuébecUniversité du Québec à Trois-RivièresNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistry of Natural Resources and ForestryUniversity of WaterlooWilfrid Laurier UniversityUniversité LavalUniversity of GuelphNatural Resources CanadaUniversité de MontréalUniversity of SaskatchewanCanadian Forest ServiceUniversity of VictoriaUniversity of British ColumbiaThe Scarborough Hospital
Organismes subventionnairesBiological and Environmental ResearchScience and Technology Facilities CouncilOffice of ScienceDeutsches Zentrum für integrative Biodiversitätsforschung Halle-Jena-LeipzigMax-Planck-GesellschaftSight Research UKNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekFondation pour la Recherche sur la BiodiversiteAXA Research FundNatural Environment Research CouncilU.S. Department of Energy
Mots-clésTraitDatabaseComputer scienceProgramming language
Résumé
Plant traits-the morphological, anatomical, physiological, biochemical and phenological characteristics of plants-determine how plants respond to environmental factors, affect other trophic levels, and influence ecosystem properties and their benefits and detriments to people. Plant trait data thus represent the basis for a vast area of research spanning from evolutionary biology, community and functional ecology, to biodiversity conservation, ecosystem and landscape management, restoration, biogeography and earth system modelling. Since its foundation in 2007, the TRY database of plant traits has grown continuously. It now provides unprecedented data coverage under an open access data policy and is the main plant trait database used by the research community worldwide. Increasingly, the TRY database also supports new frontiers of trait-based plant research, including the identification of data gaps and the subsequent mobilization or measurement of new data. To support this development, in this article we evaluate the extent of the trait data compiled in TRY and analyse emerging patterns of data coverage and representativeness. Best species coverage is achieved for categorical traits-almost complete coverage for 'plant growth form'. However, most traits relevant for ecology and vegetation modelling are characterized by continuous intraspecific variation and trait-environmental relationships. These traits have to be measured on individual plants in their respective environment. Despite unprecedented data coverage, we observe a humbling lack of completeness and representativeness of these continuous traits in many aspects. We, therefore, conclude that reducing data gaps and biases in the TRY database remains a key challenge and requires a coordinated approach to data mobilization and trait measurements. This can only be achieved in collaboration with other initiatives.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,997
Score d'incertitude au seuil0,101
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,025 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,009 | 0,010 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,004 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,006 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,030 | 0,027 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,177
Tête enseignante GPT0,385
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations2 076
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui