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Enregistrement W2983919985 · doi:10.7554/elife.32581.030

Author response: Resilience of small intestinal beneficial bacteria to the toxicity of soybean oil fatty acids

2018· peer-review· en· W2983919985 sur OpenAlexaff
Sara C. Di Rienzi, Juliet Jacobson, Elizabeth A. Kennedy, Mary Elizabeth Bell, Qiaojuan Shi, Jillian L. Waters, Peter Lawrence, J. Thomas Brenna, Robert A. Britton, Jens Walter, Ruth E. Ley

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyLinoleic acidFatty acidHuman nutritionSoybean oilFood scienceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Though “you are what you eat” may just be a figure of speech, it is clear that what we eat does affect our own cells and the microbes that live in our gut. During the 20th century, the American diet changed dramatically and now includes a lot more vegetable oil from soybeans, the main component of which – a fat called linoleic acid – is toxic to many microbes. Among the microbes inhibited by linoleic acid is a beneficial bacterium called Lactobacillus reuteri. This microbe has become less common in Western populations, and the timing of its decline approximately follows when the consumption of soybean oil began increasing. However, L. reuteri and other related microbes still exist in people who eat a Western diet. This suggests that these bacteria must be protected from linoleic acid in the gut, or that they can become resistant to this toxic molecule. Now, Di Rienzi et al. report that both protection in the gut and resistance could explain how L. reuteri can persist in the presence of linoleic acid. First, experiments in the laboratory showed that these microbes could indeed become resistant to linoleic acid, either by gaining mutations in genes involved in creating fats, by growing in an acid, and by forming a cell wall. Further experiments involving mice then showed that the gut protects also L. reuteri from this molecule: linoleic acid did not inhibit L. reuteri within the mouse, but those same L. reuteri were inhibited when grown outside of a mouse. Di Rienzi et al. went on to recover some resistant L. reuteri from mice, implying that there is a mix of resistant and non-resistant strains in the mouse gut. However, notably, the resistant bacteria recovered from the mice did not have mutations in the genes that had been identified from the earlier experiments. Together these findings show that gut bacteria have several means of surviving the high levels of potentially toxic fat molecules. Also, the specific finding that linoleic acid does not inhibit L. reuteri within the gut may help scientists to understand how a high fat diet affects microbes; for example, it is possible that the decrease in carbohydrates or protein that occurs in high fat diets may explain why such diets cause microbes to be lost. Lastly, and on a practical level, linoleic acid-resistant L. reuteri may in the future be used as a probiotic in foods rich in vegetable oil.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,390

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0130,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1170,046

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
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