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Enregistrement W2983942326 · doi:10.1182/blood-2019-128886

Uncertainty in the R2 Calibration Curve for High Iron Concentration

2019· article· en· W2983942326 sur OpenAlexaff
John C. Wood, Eamon Doyle, Nilesh R. Ghugre, Thomas D. Coates

Notice bibliographique

RevueBlood · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLiver Disease Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLiver biopsyCalibrationBiopsyReproducibilityStatisticsCalibration curveNuclear medicineMedicineMathematicsComputer scienceRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: MRI assessment of liver iron concentration (LIC) has become the standard of care for monitoring iron chelation strategies. The Ferriscan R2 quantification of LIC has been validated against 338 biopsies in two large cohorts, demonstrates good interstudy reproducibility, and has strong quality control practices. However, its cost remains a challenge for many institutions, making iron measurements by R2* acquisitions more attractive. Several studies comparing LIC by R2* and by Ferriscan R2 have identified substantial bias between R2* and R2 LIC estimates. We postulated that the original Ferriscan R2 calibration overestimates LIC at high iron concentrations, causing the disagreement between the two techniques. Methods: We identified three studies comparing single echo R2 to liver biopsy (362 biopsies). We used a publicly available digital capture program(www.arizona-software.ch/graphclick) to capture the values of R2 for each liver iron concentration level. We fit the data to the existing FDA-approved calibration and compared Bland Altman agreement to liver biopsy against two other calibration curves. The first was data-derived from the aggregate liver biopsy results using a linear fit in log transformed LIC and R2 coordinates (resulting in a Power Law fit). The second was derived from a spline fit to data generated from previously published Monte Carlo simulation model from our laboratory. This model generates "synthetic" R2-iron pairs over the entire physiological range of iron overload, using ideal mathematical approximations to the MRI imaging physics. Results: Panel A demonstrates R2-LIC pairs for the aggregate liver biopsy data and the three evaluated R2-iron calibration curves. Using Bland-Altman analysis, both the Power Law (0.5 ± 4.9 mg/g) and Simulation (1.7 ± 5.1 mg/g) calibrations had 17-22% lower variance than the Ferriscan calibration (-1.1 ± 6.2 mg/g), p<0.0001 by two sample variance test. More importantly, the predicted LIC values diverge dramatically for R2 values greater than 155 Hz (roughly 14 mg/g) (Panel B). For example, a R2 value of 300 Hz will yield an estimated LIC of 48 mg/g by Ferriscan but only 34 mg/g and 32.5 mg/g by the Power Law and Simulation calibrations respectively. Discussion: These data suggest that Ferriscan overestimates true liver iron concentration for R2 values exceeding 155 Hz, with the differences growing geometrically. The calibration error is sufficient to completely explain the differences between LIC by R2* and Ferriscan R2 described in previously studies. Importantly, any future attempt to "calibrate" R2* or other MRI methods against Ferriscan need to account for this bias. Fortunately, the clinical impact of the observed calibration bias is manageable. Patients with LIC below 14 mg/g are being accurately risk stratified. Patients with LIC greater than 14 mg/g in their liver are universally at high risk and should be treated aggressively, regardless. Serial trends in LIC-R2 values also lessen the impact of calibration bias. Both Ferriscan and R2* LIC estimates and provide accurate estimates of chelator efficiency on an annual basis. Further, both Ferriscan and liver R2* LIC estimates are more accurate than liver biopsy in tracking changes in total body iron concentration. However, hematologists should treat Ferriscan predicted LIC values of more than 14 mg/g with appropriate caution and integrate the predicted LIC values with the patient's entire clinical picture to avoid over-reacting to large changes in predicted LIC. ACKNOWLEDGEMENTS This work supported by the National Institutes of Health, Diabetes, Digestive and Kidney Diseases (1R01DK097115-01A1). DISCLOSURES Dr. Wood serves as a consultant to Apopharma, Biomedinformatics, Bluebirdbio, Celgene, Ionis Pharmaceuticals, Imago Biosciences, Silence Therapeutics, and World Care Clinical. Figure Disclosures Wood: National Institutes of Health: Research Funding; Celgene: Consultancy; Apopharma: Consultancy; WorldcareClinical: Consultancy; BluebirdBio: Consultancy; Imago Biosciences: Consultancy; BiomedInformatics: Consultancy; Philips Healthcare: Research Funding. Coates:celgene: Consultancy, Honoraria, Other: steering committee of clinical study; vifor: Consultancy, Honoraria; apo pharma: Consultancy, Honoraria, Speakers Bureau; agios pharma: Consultancy, Honoraria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,047
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,116
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,249

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0470,116
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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