Structural studies of the eIF4E–VPg complex reveal a direct competition for capped RNA: Implications for translation
Notice bibliographique
Résumé
Viruses have transformed our understanding of mammalian RNA processing, including facilitating the discovery of the methyl-7-guanosine (m 7 G) cap on the 5′ end of RNAs. The m 7 G cap is required for RNAs to bind the eukaryotic translation initiation factor eIF4E and associate with the translation machinery across plant and animal kingdoms. The potyvirus-derived viral genome-linked protein (VPg) is covalently bound to the 5′ end of viral genomic RNA (gRNA) and associates with host eIF4E for successful infection. Divergent models to explain these observations proposed either an unknown mode of eIF4E engagement or a competition of VPg for the m 7 G cap-binding site. To dissect these possibilities, we resolved the structure of VPg, revealing a previously unknown 3-dimensional (3D) fold, and characterized the VPg–eIF4E complex using NMR and biophysical techniques. VPg directly bound the cap-binding site of eIF4E and competed for m 7 G cap analog binding. In human cells, VPg inhibited eIF4E-dependent RNA export, translation, and oncogenic transformation. Moreover, VPg formed trimeric complexes with eIF4E–eIF4G, eIF4E bound VPg– luciferase RNA conjugates, and these VPg–RNA conjugates were templates for translation. Informatic analyses revealed structural similarities between VPg and the human kinesin EG5. Consistently, EG5 directly bound eIF4E in a similar manner to VPg, demonstrating that this form of engagement is relevant beyond potyviruses. In all, we revealed an unprecedented modality for control and engagement of eIF4E and show that VPg–RNA conjugates functionally engage eIF4E. As such, potyvirus VPg provides a unique model system to interrogate eIF4E.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».