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Enregistrement W2984384176 · doi:10.1021/acs.jpcb.9b09090

Doubly Charged Small Organic Fragments Derived from [Ce(tripeptide)(CH<sub>3</sub>CN)<i><sub>m</sub></i>]<sup>3+</sup> Complexes: Observation of the Elusive [b<i><sub>n</sub></i> + H]<sup>2+</sup> Ions

2019· article· en· W2984384176 sur OpenAlexafffund
Yating Wang, Justin Kai‐Chi Lau, Cheuk‐Kuen Lai, Alan C. Hopkinson, K. W. Michael Siu

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of WindsorYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryTripeptideProtonationAmideIonDissociation (chemistry)CrystallographyStereochemistryResidue (chemistry)Metal ions in aqueous solutionPeptide bondPeptidePhysical chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

[a 3 + H] 2+ ions generated from Ln 3+ /tripeptide complexes, where Ln = La or Ce, have similar structures to the linear [a n ] + ions but with protonation at both the terminal NH 2 and N═CH 2 groups. Ion stability is favored by having the basic secondary amine of the proline residue at the N-terminus and by an amino acid residue accommodating one of the protons on the side chain. Dissociation of [a 3 + H] 2+ ions derived from peptides containing only aliphatic residues is by cleavage of the second amide bond to give [b 2 ] + or [a 2 ] + ions along with internal [a 1 ] + ions. For [a 3 + H] 2+ ions containing a tryptophan residue in the central location, in addition to cleavage of the amide bond, losses of neutrals NH 3, HN═CHR, (NH 3 + CO), and HNCO were observed. Dissociations of some unsolvated Ln 3+ /tripeptide complexes gave [b 3 + H] 2+ ions in low abundance; formation of these [b 3 + H] 2+ ions was favored by the presence of a proline residue at the N-terminus and by either a histidine or tryptophan residue in the central position. Dissociation of these [b 3 + H] 2+ ions was by the loss of (H 2 O + CO) and not only CO, indicating that these ions did not have the same type of oxazolone structure as found for [b n ] + ions. Density functional theory calculations suggest that the observed [b 3 + H] 2+ ions of ProGlyGly were formed from [Ce(ProGlyGly)] 3+ complexes in which the peptide was bound to the metal ion as an enolate. Dissociation of the slightly lower-energy complex, where the peptide is bound in the keto form, would produce an oxazolone but the high barrier required to create this isomer of the [b 3 + H] 2+ ion would be sufficient to result in further dissociation. Two isomers of the [b 3 + H] 2+ ion of ProHisGly have been created, one from the [Ce(ProHisGly)] 3+ complex that characteristically dissociates by the combined loss of (H 2 O + CO) and the other by the loss of glycine from [ProHisGlyGly + 2H] 2+ . The [b 3 + H] 2+ ion derived from [ProHisGlyGly + 2H] 2+ dissociated by the loss of only CO.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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