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Enregistrement W2985127946 · doi:10.7554/elife.16962.048

Author response: The CNS connectome of a tadpole larva of Ciona intestinalis (L.) highlights sidedness in the brain of a chordate sibling

2016· peer-review· en· W2985127946 sur OpenAlexaff
Kerrianne Ryan, Zhiyuan Lu, Ian A. Meinertzhagen

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueCephalopods and Marine Biology
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChordateNeuroscienceBiologyConnectomeCiona intestinalisAnatomyCionaVertebrateFunctional connectivity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Brains are made up of a network of nerve cells (neurons) that are connected to each other by junctions called synapses. The neurons on the left and right sides of the brain form different patterns of connections, but this asymmetry can be difficult to spot because the brain is large and complex. Understanding how the whole network operates is key to understanding how the brain works. However, a full map of all the connections between neurons – known as a connectome – has only been described for one species so far, a nematode worm called C. elegans. The tadpole larva of the common sea squirt has a fairly simple brain distantly related to our own but made up of only about 330 cells. Ryan et al. used a technique called electron microscopy to study thin sections from the brains of sea squirt larvae to reveal this animal’s connectome and investigate left-right asymmetry in the brain. The analysis revealed 177 neurons in this larval brain, just over half of its brain cells. These can be split into at least 25 types and each neuron has a simple, mostly unbranched shape with, on average, 49 synapses with other cells. This means that, even though it has such a small number of neurons, the neuron network is still relatively complex. The shortest sensory pathway to any muscle connects via three synapses, although most pathways involve more. The left and right sides of the brain differ in the types of neurons they contain and the connections these form, even though both sides have the same number of cells. The findings of Ryan et al. reveal the second animal connectome and lay the groundwork for future studies on how each neuron in the network influences the behaviour of the sea squirt’s larva. Further work is also required to find out how the patterns of synapses in the brain change as the larva ages, and whether the connectome differs between siblings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,246
Score d'incertitude au seuil0,821

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2460,045

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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