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Enregistrement W2986324625 · doi:10.1016/j.cub.2019.09.074

Intracellular Infection of Diverse Diatoms by an Evolutionary Distinct Relative of the Fungi

2019· article· en· W2986324625 sur OpenAlexafffund
Aurélie Chambouvet, Adam Monier, Finlay Maguire, Sarah Itoïz, Javier del Campo, Philippe Eliès, Bente Edvardsen, Wenche Eikreim, Thomas A. Richards

Notice bibliographique

RevueCurrent Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensCanadian Bioethics Society
Organismes subventionnairesGenome AtlanticAgence Nationale de la RechercheSight Research UKRoyal SocietyNatural Environment Research CouncilGordon and Betty Moore FoundationBiodiversa+Genome Canada
Mots-clésBiologyDiatomProtistRibosomal RNALineage (genetic)EcologyPhylogeneticsChytridiomycotaEvolutionary biologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Fungi are a diverse kingdom, dominating terrestrial environments and driving important ecologies. Although fungi, and the related Opisthosporidia, interact with photosynthetic organisms on land and in freshwater as parasites, symbionts, and/or saprotrophic degraders [1, 2], such interactions in the marine environment are poorly understood [3-8]. One newly identified uncultured marine lineage has been named novel chytrid-like-clade-1 (NCLC1) [4] or basal-clone-group-I [5, 6]. We use ribosomal RNA (rRNA) encoding gene phylogenies to demonstrate that NCLC1 is a distinct branch within the Opisthosporidia (Holomycota) [7]. Opisthosporidia are a diverse and largely uncultured group that form a sister branch to the Fungi or, alternatively, the deepest branch within the Fungi, depending on how the boundary to this kingdom is inferred [9]. Using culture-free lineage-specific rRNA-targeted fluorescent in situ hybridization (FISH) microscopy, we demonstrate that NCLC1 cells form intracellular infection of key diatom species, establishing that intracellular colonization of a eukaryotic host is a consistent lifestyle across the Opisthosporidia [8-11]. NCLC1 infection-associated loss and/or envelopment of the diatom nuclei infers a necrotrophic-pathogenic interaction. Diatoms are one of the most diverse and ecologically important phytoplankton groups, acting as dominant primary producers and driving carbon fixation and storage in many aquatic environments [12-14]. Our results provide insight into the diversity of microbial eukaryotes that interact with diatoms. We suggest that such interactions can play a key role in diatom associated ecosystem functions, such as the marine carbon pump through necrotrophic-parasitism, facilitating the export of diatoms to the sediment [15, 16].

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,241

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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