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Enregistrement W2986352532 · doi:10.1021/acsomega.9b02507

Small Polar Hits against <i>S. aureus</i>: Screening, Initial Hit Optimization, and Metabolomic Studies

2019· article· en· W2986352532 sur OpenAlexaff
Andrew Lim, Isabel M. Vincent, Michael P. Barrett, Ian H. Gilbert

Notice bibliographique

RevueACS Omega · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesMerck Sharp and Dohme
Mots-clésMetabolomicsMode of actionChemical libraryDrug discoveryChemistryStaphylococcus aureusComputational biologyCombinatorial chemistryAntibacterial activityBiologyBiochemistryBacteriaChromatographySmall moleculeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The global prevalence of antibacterial resistance requires new antibacterial drugs with novel chemical scaffolds and modes of action. It is also vital to design compounds with optimal physicochemical properties to permeate the bacterial cell envelope. We described an approach of combining and integrating whole cell screening and metabolomics into early antibacterial drug discovery using a library of small polar compounds. Whole cell screening of a diverse library of small polar compounds against Staphylococcus aureus gave compound 2. Hit expansion was carried out to determine structure–activity relationships. A selection of compounds from this series, together with other screened active compounds, was subjected to an initial metabolomics study to provide a metabolic fingerprint of the mode of action. It was found that compound 2 and its analogues have a different mode of action from some of the known antibacterial compounds tested. This early study highlighted the potential of whole cell screening and metabolomics in early antibacterial drug discovery. Future works will require improving potency and performing orthogonal studies to confirm the modes of action.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,329
Score d'incertitude au seuil0,562

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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