MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2986848757 · doi:10.1098/rstb.2019.0212

Consequences of past climate change and recent human persecution on mitogenomic diversity in the arctic fox

2019· article· en· W2986848757 sur OpenAlexaff
Petter Larsson, Johanna von Seth, Ingerid J. Hagen, Anders Götherström, Semyon Androsov, Mietje Germonpré, Nora Bergfeldt, Sergey Fedorov, Nina E. Eide, Natalia Sokolova, Dominique Berteaux, Anders Angerbjörn, Øystein Flagstad, В. В. Плотников, Karin Norén, David Díez‐del‐Molino, Nicolás Dussex, David W. G. Stanton, Love Dalén

Notice bibliographique

RevuePhilosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversité du Québec à Rimouski
Organismes subventionnairesUppsala Multidisciplinary Center for Advanced Computational ScienceRussian Academy of SciencesRussian Foundation for Basic ResearchNorges ForskningsrådH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsCarl Tryggers Stiftelse för Vetenskaplig ForskningScience for Life LaboratorySvenska Forskningsrådet Formas
Mots-clésClimate changePleistocenePopulationPersecutionArcticAncient DNAGeographyEcologyGlobal warmingPopulation bottleneckLast Glacial MaximumArctic foxGlacial periodHoloceneBiologyPaleontologyArchaeologyDemographyLagopus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ancient DNA provides a powerful means to investigate the timing, rate and extent of population declines caused by extrinsic factors, such as past climate change and human activities. One species probably affected by both these factors is the arctic fox, which had a large distribution during the last glaciation that subsequently contracted at the start of the Holocene. More recently, the arctic fox population in Scandinavia went through a demographic bottleneck owing to human persecution. To investigate the consequences of these processes, we generated mitogenome sequences from a temporal dataset comprising Pleistocene, historical and modern arctic fox samples. We found no evidence that Pleistocene populations in mid-latitude Europe or Russia contributed to the present-day gene pool of the Scandinavian population, suggesting that postglacial climate warming led to local population extinctions. Furthermore, during the twentieth-century bottleneck in Scandinavia, at least half of the mitogenome haplotypes were lost, consistent with a 20-fold reduction in female effective population size. In conclusion, these results suggest that the arctic fox in mainland Western Europe has lost genetic diversity as a result of both past climate change and human persecution. Consequently, it might be particularly vulnerable to the future challenges posed by climate change. This article is part of a discussion meeting issue 'The past is a foreign country: how much can the fossil record actually inform conservation?'

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,091
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePhilosophical Transactions of the Royal Society B Biological SciencesMême sujetGenetic diversity and population structureTravaux en français237 207