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Enregistrement W2986930146 · doi:10.1038/s41598-019-52366-4

A Novel Semiconductor-Based Flow Cytometer with Enhanced Light-Scatter Sensitivity for the Analysis of Biological Nanoparticles

2019· article· en· W2986930146 sur OpenAlexafffund
George C. Brittain, Yong Q. Chen, Edgar Martinez, Vera A. Tang, Tyler M. Renner, Marc‐André Langlois, Sergei Gulnik

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensInstitute of Infection and ImmunityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésFlow cytometryMaterials sciencePhotodiodeParticle (ecology)OptoelectronicsBiologyMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The CytoFLEX is a novel semiconductor-based flow cytometer that utilizes avalanche photodiodes, wavelength-division multiplexing, enhanced optics, and diode lasers to maximize light capture and minimize optical and electronic noise. Due to an increasing interest in the use of extracellular vesicles (EVs) as disease biomarkers, and the growing desire to use flow cytometry for the analyses of biological nanoparticles, we assessed the light-scatter sensitivity of the CytoFLEX for small-particle detection. We found that the CytoFLEX can fully resolve 70 nm polystyrene and 98.6 nm silica beads by violet side scatter (VSSC). We further analyzed the detection limit for biological nanoparticles, including viruses and EVs, and show that the CytoFLEX can detect viruses down to 81 nm and EVs at least as small as 65 nm. Moreover, we could immunophenotype EV surface antigens, including directly in blood and plasma, demonstrating the double labeling of platelet EVs with CD61 and CD9, as well as triple labeling with CD81 for an EV subpopulation in one donor. In order to assess the refractive indices (RIs) of the viruses and EVs, we devised a new method to inversely calculate the RIs using the intensity vs. size data together with Mie-theory scatter efficiencies scaled to reference-particle measurements. Each of the viruses tested had an equivalent RI, approximately 1.47 at 405 nm, which suggests that flow cytometry can be more broadly used to easily determine virus sizes. We also found that the RIs of EVs increase as the particle diameters decrease below 150 nm, increasing from 1.37 for 200 nm EVs up to 1.61 for 65 nm EVs, expanding the lower range of EVs that can be detected by light scatter. Overall, we demonstrate that the CytoFLEX has an unprecedented level of sensitivity compared to conventional flow cytometers. Accordingly, the CytoFLEX can be of great benefit to virology and EV research, and will help to expand the use of flow cytometry for minimally invasive liquid biopsies by allowing for the direct analysis of antigen expression on biological nanoparticles within patient samples, including blood, plasma, urine and bronchoalveolar lavages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,323

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations113
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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