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Enregistrement W2987749280 · doi:10.1136/jnnp-2019-abn-2.216

272 Inherited peripheral neuropathies: analysis of PDXK gene identifies a new treatable disorder

2019· article· en· W2987749280 sur OpenAlexaff
Viorica Chelban, Matthew P. Wilson, Natalia Zanetti, Eleni Zamba‐Papanicolaou, Maria R. Conte, Carla Cordivari, Philippa B. Mills, Nicholas Wood, Peter T. Clayton, Henry Houlden

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurology Neurosurgery & Psychiatry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurological diseases and metabolism
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutationPolyneuropathyPyridoxalMolecular biologyBiologyGeneBiochemistryChemistryMedicineEnzymePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polyneuropathies are amongst the most common neurological conditions worldwide affecting over 20 million people. However, 40% of patients with primary polyneuropathies have no disease-causing mutation identified. We investigated patients with gene-negative primary polyneuropathies using a combination of whole genome sequencing, homozigosity mapping and segregation analysis. Pathogenicity was confirmed via enzymatic assays and mass spectroscopy on recombinant protein and patient-derived fibroblasts, plasma and erythrocytes. We used circular dichroism to show secondary structure changes and isothermal titration calorimetry to investigate the ATP binding. We report that biallelic mutations in human PDXK are associated with primary axonal polyneuropathy and optic atrophy. Pyridoxal kinase (PDXK) is involved in converting vitamin B6 to its active form, pyridoxal 5’-phosphate (PLP). We show that PDXK mutations lead to disease via decreased plasma PLP concentrations. Our functional studies revealed conformational rearrangement in the mutant enzyme around the kinase ATP-binding pocket with impaired PDXK ability to bind ATP and leading to reduced erythrocyte PDXK activity. We show that both the human clinical picture and biochemical profile in PDXK mutations are rescued by PLP supplementation. Patients regained their ability to walk independently. Furthermore, treatment-led normalisation of plasma PLP levels, correlated with reduction of neurofilament light chain concentrations, a biomarker of axonal breakdown. In conclusion, biallelic mutations in human PDXK are associated with a novel disorder leading to treatable primary axonal polyneuropathy and optic atrophy and identifies PLP as therapeutic target.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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