MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2987794972 · doi:10.1053/j.gastro.2019.11.019

Drug Screen Identifies Leflunomide for Treatment of Inflammatory Bowel Disease Caused by TTC7A Deficiency

2019· article· en· W2987794972 sur OpenAlexafffund
Sasha Jardine, Sierra Anderson, Stephen Babcock, Gabriella Leung, Jie Pan, Neel Dhingani, Neil Warner, Conghui Guo, Iram Siddiqui, Daniel Kotlarz, James J. Dowling, Roman A. Melnyk, Scott B. Snapper, Christoph Klein, Jay R. Thiagarajah, Aleixo M. Muise

Notice bibliographique

RevueGastroenterology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIntestinal Malrotation and Obstruction Disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick ChildrenSickKids Foundation
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAmerican Gastroenterological AssociationLeona M. and Harry B. Helmsley Charitable TrustCanada Research ChairsNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesBoston Children's Hospital
Mots-clésLeflunomideInflammatory bowel diseaseDrugMedicineDiseaseDrug treatmentGastroenterologyInternal medicinePharmacologyMethotrexate

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background & Aims Mutations in the tetratricopeptide repeat domain 7A gene ( TTC7A ) cause intestinal epithelial and immune defects. Patients can become immune deficient and develop apoptotic enterocolitis, multiple intestinal atresia, and recurrent intestinal stenosis. The intestinal disease in patients with TTC7A deficiency is severe and untreatable, and it recurs despite resection or allogeneic hematopoietic stem cell transplant. We screened drugs for those that prevent apoptosis of in cells with TTC7A deficiency and tested their effects in an animal model of the disease. Methods We developed a high-throughput screen to identify compounds approved by the US Food and Drug Administration that reduce activity of caspases 3 and 7 in TTC7A - knockout (TTC7A-KO) HAP1 (human haploid) cells and reduce the susceptibility to apoptosis. We validated the effects of identified agents in HeLa cells that stably express TTC7A with point mutations found in patients. Signaling pathways in cells were analyzed by immunoblots. We tested the effects of identified agents in zebrafish with disruption of ttc7a , which develop intestinal defects, and colonoids derived from biopsy samples of patients with and without mutations in TTC7A . We performed real-time imaging of intestinal peristalsis in zebrafish and histologic analyses of intestinal tissues from patients and zebrafish. Colonoids were analyzed by immunofluorescence and for ion transport. Results TTC7A-KO HAP1 cells have abnormal morphology and undergo apoptosis, due to increased levels of active caspases 3 and 7. We identified drugs that increased cell viability; leflunomide (used to treat patients with inflammatory conditions) reduced caspase 3 and 7 activity in cells by 96%. TTC7A-KO cells contained cleaved caspase 3 and had reduced levels of phosphorylated AKT and X-linked inhibitor of apoptosis (XIAP); incubation of these cells with leflunomide increased levels of phosphorylated AKT and XIAP and reduced levels of cleaved caspase 3. Administration of leflunomide to ttc7a –/– zebrafish increased gut motility, reduced intestinal tract narrowing, increased intestinal cell survival, increased sizes of intestinal luminal spaces, and restored villi and goblet cell morphology. Exposure of patient-derived colonoids to leflunomide increased cell survival, polarity, and transport function. Conclusions In a drug screen, we identified leflunomide as an agent that reduces apoptosis and activates AKT signaling in TTC7A-KO cells. In zebrafish with disruption of ttc7a , leflunomide restores gut motility, reduces intestinal tract narrowing, and increases intestinal cell survival. This drug might be repurposed for treatment of TTC7A deficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGastroenterologyMême sujetIntestinal Malrotation and Obstruction DisordersTravaux en français237 207