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Enregistrement W2987966628 · doi:10.1016/j.dadm.2019.09.002

Blood‐based protein predictors of dementia severity as measured by δ: Replication across biofluids and cohorts

2019· article· en· W2987966628 sur OpenAlexfundno aff
Donald R. Royall, Ram Bishnoi, Raymond F. Palmer, Valory Pavlik, Paul J. Massman, Eveleen Darby, Monica Rodriguear, Aisha Khaleeq Ansari, John C. DeToledo, Hemachandra Reddy, Henrick Wilms, Kim G. Johnson, Victòria Aurora Ferrer Pérez, Thomas Fairchild, Janice Knebl, Sid E. O’Bryant, James Hall, Leigh Johnson, Robert C. Barber, Douglas Mains, Lisa Alvarez, C. Munro Cullum, Roger N. Rosenberg, Benjamin J. Williams, Mary Quiceno, Joan Reisch, Linda S. Hynan, Ryan Huebinger, Janet Smith, Trung Nguyen, Marsha Polk, Alan Stevens, Marcia G. Ory, David Paydarfar, John Bertelson, Martin Woon, Gayle Ayres, Alyssa Aguirre, Kirk C. Wilhelmsen, Jeffrey L. Tilson

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia Diagnosis Assessment & Disease Monitoring · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute on AgingNational Institutes of HealthAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeU.S. Department of Defense
Mots-clésDementiaApolipoprotein EBiomarkerInflammationNeuroimagingOncologyDiseaseReplicateInternal medicinePsychologyMedicineClinical psychologyBioinformaticsBiologyGeneticsNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Dementia severity can be empirically described by the latent dementia phenotype "δ" and its various composite "homologs". We have explored δ's blood-based protein biomarkers in the Texas Alzheimer's Research and Care Consortium (TARCC) study. However, it would be convenient to replicate those associations in the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI). To this end, we recently engineered a δ homolog from observed cognitive performance measures common to both projects (i.e., "dT2A"). METHODS: We used nine rationally chosen peripheral blood-based protein biomarkers as indicators of a latent variable "INFLAMMATION". We then associated that construct with dT2A in structural equation models adjusted for age, gender, depressive symptoms, and apolipoprotein E (APOE) ε4 allelic burden. Significant factor loadings and INFLAMMATION's association with dT2A were confirmed in random splits of TARCC's relatively large sample, and across biofluids in the ADNI. RESULTS: Nine proteins measured in serum (TARCC) or plasma (ADNI) explained ≅10% of dT2A's variance in both samples, independently of age, APOE, education, and gender. All loaded significantly on INFLAMMATION, and positively or negatively, depending on their known roles are PRO- or ANTI-inflammatory proteins, respectively. The parameters of interest were confirmed across random 50% splits of the TARCC's sample, and replicated across biofluids in the ADNI. DISCUSSION: These results suggest that SEM can be used to replicate biomarker findings across samples and biofluids, and that a substantial fraction of dementia's variance is attributable to peripheral blood-based protein levels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,027
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,101

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,027
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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