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Enregistrement W2987983801 · doi:10.1088/1361-6560/ab5427

Automatic classification of dental artifact status for efficient image veracity checks: effects of image resolution and convolutional neural network depth

2019· article· en· W2987983801 sur OpenAlexafffund
Mattea Welch, Chris McIntosh, Leonard Wee, Alberto Traverso, André Dekker, Benjamin Haibe‐Kains, David A. Jaffray

Notice bibliographique

RevuePhysics in Medicine and Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensVector InstitutePrincess Margaret Cancer CentreInstitute of Cancer ResearchOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox Research InstituteOntario Institute for Cancer Research
Mots-clésConvolutional neural networkArtificial intelligenceComputer scienceResamplingImage qualityRobustness (evolution)Pattern recognition (psychology)Quality assuranceGridVisualizationArtifact (error)Computer visionImage (mathematics)MathematicsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Enabling automated pipelines, image analysis and big data methodology in cancer clinics requires thorough understanding of the data. Automated quality assurance steps could improve the efficiency and robustness of these methods by verifying possible data biases. In particular, in head and neck (H&N) computed-tomography (CT) images, dental artifacts (DA) obscure visualization of structures and the accuracy of Hounsfield units; a challenge for image analysis tasks, including radiomics, where poor image quality can lead to systemic biases. In this work we analyze the performance of three-dimensional convolutional neural networks (CNN) trained to classify DA statuses. 1538 patient images were scored by a single observer as DA positive or negative. Stratified five-fold cross validation was performed to train and test CNNs using various isotropic resampling grids (64 3 , 128 3 and 256 3 ), with CNN depths designed to produce 32 3 , 16 3 , and 8 3 machine generated features. These parameters were selected to determine if more computationally efficient CNNs could be utilized to achieve the same performance. The area under the precision recall curve (PR-AUC) was used to assess CNN performance. The highest PR-AUC (0.92 ± 0.03) was achieved with a CNN depth = 5, resampling grid = 256. The CNN performance with 256 3 resampling grid size is not significantly better than 64 3 and 128 3 after 20 epochs, which had PR-AUC = 0.89 ± 0.03 ( p -value = 0.28) and 0.91 ± 0.02 ( p -value = 0.93) at depths of 3 and 4, respectively. Our experiments demonstrate the potential to automate specific quality assurance tasks required for unbiased and robust automated pipeline and image analysis research. Additionally, we determined that there is an opportunity to simplify CNNs with smaller resampling grids to make the process more amenable to very large datasets that will be available in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,632
Score d'incertitude au seuil0,308

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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