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Enregistrement W2988310352 · doi:10.1083/jcb.201812044

Tumor protein D54 defines a new class of intracellular transport vesicles

2019· article· en· W2988310352 sur OpenAlexfundno aff
Gabrielle Larocque, Penelope J. La-Borde, Nicholas I. Clarke, Nicholas J Carter, Stephen Royle

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Cell Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesWellcomeMedical Research CouncilUniversity of WarwickCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésRabVesicleIntracellularCell biologyTransport proteinBiologyGolgi apparatusGTPaseLipid microdomainMembraneBiochemistryEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transport of proteins and lipids from one membrane compartment to another is via intracellular vesicles. We investigated the function of tumor protein D54 (TPD54/TPD52L2) and found that TPD54 was involved in multiple membrane trafficking pathways: anterograde traffic, recycling, and Golgi integrity. To understand how TPD54 controls these diverse functions, we used an inducible method to reroute TPD54 to mitochondria. Surprisingly, this manipulation resulted in the capture of many small vesicles (30 nm diameter) at the mitochondrial surface. Super-resolution imaging confirmed the presence of similarly sized TPD54-positive structures under normal conditions. It appears that TPD54 defines a new class of transport vesicle, which we term intracellular nanovesicles (INVs). INVs meet three criteria for functionality. They contain specific cargo, they have certain R-SNAREs for fusion, and they are endowed with a variety of Rab GTPases (16 out of 43 tested). The molecular heterogeneity of INVs and the diverse functions of TPD54 suggest that INVs have various membrane origins and a number of destinations. We propose that INVs are a generic class of transport vesicle that transfer cargo between these varied locations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,336

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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