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Enregistrement W2988836760 · doi:10.1021/acs.analchem.9b03980

Cytoplasmic Protein-Powered In Situ Fluorescence Amplification for Intracellular Assay of Low-Abundance Analyte

2019· article· en· W2988836760 sur OpenAlexaff
Yibo Zhou, Sheng Yang, Yue Xiao, Zhen Zou, Zhihe Qing, Juewen Liu, Ronghua Yang

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of ChinaNatural Science Foundation of Hunan ProvinceEducation Department of Hunan Province
Mots-clésChemistryCytoplasmFluorescenceAnalyteDetection limitBiophysicsFluorophoreIntracellularNanotechnologyBiochemistryChromatographyBiologyMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fluorescence amplification is critical for in situ and real-time detection of intracellular low abundance biological species. However, current intracellular amplification techniques mainly rely on synthetic nucleic acid-based nanodevices, manipulating them in living cells remains challenging. To solve this problem, herein, a new signal amplification concept named cytoplasmic protein-powered in situ fluorescence amplification (CPFA) is proposed. CPFA takes cytoplasmic protein as cell-self-power for signal amplification enabling it to operate in living cells. To establish a prototype of CPFA, an amplifiable sensor for hydroxyl radicals (•OH) was designed by entrapping the screened cytoplasmic protein-enhanced fluorophore (PBF1) inside mesoporous silica (MSN) nanocontainer with ssDNA/PTAD-based signal switch. When encountered with •OH in living cells, the ssDNA was cleaved to separate PTAD from MSN, liberating multiple copies of the loaded PBF1 to light up the fluorescence. Furthermore, these released PBF1 molecules can instantly bind with cytoplasmic proteins to amplify their fluorescence signals. Take advantage of this two-stage amplification mode, the sensor in response to •OH exhibited remarkable fluorescence enhancement (near 400-fold) in cell lysates, and the •OH was linearly determined from 0 to 800 nM with a detection limit of 6.4 pM. Moreover, this sensor can track basal level and fluctuation of •OH in living cells on account of its high sensitivity. To our knowledge, this is the first effort to use cytoplasmic protein for amplifying detection signals, which will provide a new dimension to current methodologies for low-abundance biomarkers discovery and regulation for chemical biology and medical diagnostics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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