Author response: Social networks predict gut microbiome composition in wild baboons
Notice bibliographique
Résumé
The digestive system is home to a complex community of microbes—known as the gut microbiome—that contributes to our health and wellbeing by digesting food, producing essential vitamins, and preventing the growth of harmful bacteria. The recent development of rapid genome sequencing techniques has made it much easier to identify the species of microbes found in the gut microbiome, and how this microbiome's composition varies between individuals. Studies in humans and other primates suggest that direct contact during social interactions may alter the composition of the gut microbiome in an individual. This could explain why there is a strong association between social interactions and health in humans and other social animals. However, similarities in the gut microbiomes of individuals within a social group could also be due to a shared diet or a common environment. The information collected during long-term studies of wild primates offers an opportunity to analyze and assess the influence of diet, environment and social interaction on the gut microbiome. Here, Tung et al. studied the gut microbiomes of 48 wild baboons belonging to two different social groups in Amboseli, Kenya. Using a technique called shotgun metagenomic sequencing, they sequenced DNA extracted from samples of feces collected from individual baboons. The sequence data revealed that an individual's social group and social network can predict the species found in its gut microbiome. This remained the case even when other factors—such as diet, kinship, and shared environments—were taken into account. Tung et al.'s findings suggest that direct physical contact during social interactions may be important in transmitting gut microbiomes between members of the same social group. However, scientists still don't know whether this exchange is good or bad for the health of the baboons. Future work will try to understand whether baboons benefit from acquiring gut microbes from their group members, and if the gut microbes of some social groups are better than others.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,047 | 0,008 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».