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Enregistrement W2989510802 · doi:10.1038/s41523-019-0127-5

The FANCM:p.Arg658* truncating variant is associated with risk of triple-negative breast cancer

2019· article· en· W2989510802 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

Revuenpj Breast Cancer · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensAmgen (Canada)University of British ColumbiaUniversity of TorontoRoyal Victoria HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversité LavalBC Cancer AgencyCentre hospitalier universitaire de QuébecMcGill UniversityQueen's University
Organismes subventionnairesDivision of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer InstituteNIH Office of the DirectorServicio Gallego de SaludNational Cancer InstituteEuropean Regional Development FundCancer Council VictoriaMedical Research CouncilEuropean CommissionLietuvos Mokslo TarybaCanadian Institutes of Health ResearchImperial Experimental Cancer Medicine CentreDivision of Cancer Prevention, National Cancer InstituteNational Institutes of HealthFreistaat SachsenCentro de Investigación Biomédica en Red de CáncerFederal Agency for Scientific OrganizationsNational Institute of General Medical SciencesDeutschen Konsortium für Translationale KrebsforschungKWF KankerbestrijdingFox Chase Cancer CenterMinistero dello Sviluppo EconomicoJewish General HospitalNational Institute for Health and Care ResearchCenters for Disease Control and PreventionMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterIstituto Oncologico VenetoInstitut National Du CancerNational Health and Medical Research CouncilDeutsche KrebshilfeFondazione Umberto VeronesiVetenskapsrådetStockholms Läns LandstingKuopion Yliopistollinen SairaalaMinistero della SaluteMcGill UniversityGeneralitat de CatalunyaCancer Center, University of KansasUniversity of Southern CaliforniaCancerfondenLandspítali HáskólasjúkrahúsMinisterio de Economía y CompetitividadNational Center for Advancing Translational SciencesBundesministerium für Bildung und ForschungItä-Suomen YliopistoEberhard Karls Universität TübingenFondation ARC pour la Recherche sur le CancerAmerican Cancer SocietyCancer AustraliaRussian Foundation for Basic ResearchDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekDeutsche ForschungsgemeinschaftDeutscher Akademischer AustauschdienstProgramme Grants for Applied ResearchRobert Bosch StiftungAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroKarolinska InstitutetHungarian Scientific Research FundHarvard T.H. Chan School of Public HealthCancer Association of South AfricaRoyal Marsden NHS Foundation TrustInstitució Catalana de Recerca i Estudis AvançatsCentres de Recerca de CatalunyaUniversity of CambridgeNemzeti Kutatási Fejlesztési és Innovációs HivatalGovernment of CanadaGeorgetown UniversityBreast Cancer CampaignNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchNational Breast Cancer FoundationNational Institute of Environmental Health SciencesSwedish Cancer FoundationMcGill University Health CentreUniversity of California, IrvineDavid F. and Margaret T. Grohne Family FoundationDeutsches KrebsforschungszentrumWorld Cancer Research FundHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriLon V. Smith FoundationMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationFundación Mutua MadrileñaBreast Cancer Research FoundationUniversity of ChicagoNRG OncologyFondation du cancer du sein du QuébecUniversitätsklinikum Hamburg-EppendorfDr. Ralph and Marian Falk Medical Research TrustKansas Bioscience AuthorityInstitut Català de la SalutUniversity of PennsylvaniaLiga Portuguesa Contra o CancroUniversity College LondonCancer Research UKBeckman Research Institute, City of HopeSusan G. Komen for the CureBeth Israel Deaconess Medical CenterGenome CanadaBrigham and Women's HospitalInstituto de Salud Carlos IIIOhio State UniversityUniversity of California, San FranciscoU.S. Department of Health and Human ServicesRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnOak FoundationFisher Center for Alzheimer's Research FoundationFanconi Anemia Research FundFonds Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésCHEK2Breast cancerPALB2Triple-negative breast cancerBiologyCancerOlaparibCancer researchGeneticsInternal medicineOncologyMedicineGermline mutationMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Breast cancer is a common disease partially caused by genetic risk factors. Germline pathogenic variants in DNA repair genes BRCA1 , BRCA2 , PALB2 , ATM , and CHEK2 are associated with breast cancer risk. FANCM , which encodes for a DNA translocase, has been proposed as a breast cancer predisposition gene, with greater effects for the ER-negative and triple-negative breast cancer (TNBC) subtypes. We tested the three recurrent protein-truncating variants FANCM :p.Arg658*, p.Gln1701*, and p.Arg1931* for association with breast cancer risk in 67,112 cases, 53,766 controls, and 26,662 carriers of pathogenic variants of BRCA1 or BRCA2 . These three variants were also studied functionally by measuring survival and chromosome fragility in FANCM −/− patient-derived immortalized fibroblasts treated with diepoxybutane or olaparib. We observed that FANCM :p.Arg658* was associated with increased risk of ER-negative disease and TNBC (OR = 2.44, P = 0.034 and OR = 3.79; P = 0.009, respectively). In a country-restricted analysis, we confirmed the associations detected for FANCM :p.Arg658* and found that also FANCM :p.Arg1931* was associated with ER-negative breast cancer risk (OR = 1.96; P = 0.006). The functional results indicated that all three variants were deleterious affecting cell survival and chromosome stability with FANCM :p.Arg658* causing more severe phenotypes. In conclusion, we confirmed that the two rare FANCM deleterious variants p.Arg658* and p.Arg1931* are risk factors for ER-negative and TNBC subtypes. Overall our data suggest that the effect of truncating variants on breast cancer risk may depend on their position in the gene. Cell sensitivity to olaparib exposure, identifies a possible therapeutic option to treat FANCM -associated tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,377
Score d'incertitude au seuil0,699

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle