Germline Polymorphisms in the Nuclear Receptors PXR and VDR as Novel Prognostic Markers in Metastatic Colorectal Cancer Patients Treated With FOLFIRI
Notice bibliographique
Résumé
Nuclear receptors act as mediators of cancer-related inflammation and gene expression. They have a regulatory effect on genes encoding proteins related to drug adsorption, distribution, metabolism, and excretion. The aim of the present study was to highlight novel prognostic markers among polymorphisms in genes encoding for nuclear receptor proteins and inflammation-related cytokines in patients treated with a FOLFIRI regimen. This study included two independent cohorts comprising a total of 337 mCRC patients homogeneously treated with first-line FOLFIRI. Genotyping of 246 haplotype-tagging polymorphisms in 22 genes was performed using bead array technology. The NR1I2 (PXR)-rs1054190 and VDR-rs7299460 polymorphisms were significantly associated with patient overall survival (OS). A detrimental effect of the NR1I2 rs1054190-TT genotype on OS was observed in both the discovery and replication cohorts (HR=6.84, P=0.0021, q-value=0.1278 and HR=3.56, P=0.0414, respectively). Patients harboring the NR1I2 rs1054190-TT genotype had a median OS of 9 months vs. 21 months in patients with C-allele (P<0.0001 log-rank test). VDR rs7299460-T was consistently associated with a longer OS in both cohorts (discovery: HR=0.61, P=0.0075, q-value=0.1535; replication: HR=0.57, P=0.0477). Patients with the VDR rs7299460-T allele had a median OS of 23 months compared to 18 months in those with the CC genotype (P=0.0489, log-rank test). The NR1I2-rs1054190 polymorphism also had an effect on the duration of progression-free survival, consistent with the effect observed on OS. Two novel prognostic markers for mCRC treated with FOLFIRI were described and, if validated by prospective trials, have a potential application in the management of these patients
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».