DNA barcoding of spiders from agricultural fields
Notice bibliographique
Résumé
In the present study, DNA barcoding was used to assess the percentage accuracy of morphological base identification of spiders from the agriculture fields of district Layyah, Punjab, Pakistan. A total of 872 spiders were captured from June to August of 2017. All the collected spiders were brought to molecular laboratory at GC University Lahore, preserved in 95% ethanol and stored at -20 °C until the DNA extraction. Spiders were evaluated morphologically on the basis of different identification Keys and Catalogs. Morphological identification revealed the presence of 12 families, 29 genra and 49 species. To evaluate the authenticity of morphological identification, tissue samples of 96 specimens were sent to Canadian Center for Biodiversity and Genomics, University of Guelph, Canada. A 658-base pair sequence of COI (Cytochrome c Oxidase Subunit I) of 90 specimens was retrieved successfully, which confirmed the presence of 11 families, 25 genra and 47 species. On the basis of molecular results, all the misidentified specimens were then allotted the correct taxon. Overall accuracy of morphological based identification was 88%. It is concluded from the present study that morphological investigations to identify a spider, are satisfactory but to enhance the accuracy, pace and credibility of results, molecular technique like DNA barcoding is considerable. Furthermore, to magnify authenticity of evaluation of spiders, integrated barcoding- combination of molecular methods and conventional taxonomy- is compulsory.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».