Convergent patterns of evolution of mitochondrial oxidative phosphorylation (OXPHOS) genes in electric fishes
Notice bibliographique
Résumé
The ability to generate and detect electric fields has evolved in several groups of fishes as a means of communication, navigation and, occasionally, predation. The energetic burden required can account for up to 20% of electric fishes' daily energy expenditure. Despite this, molecular adaptations that enable electric fishes to meet the metabolic demands of bioelectrogenesis remain unknown. Here, we investigate the molecular evolution of the mitochondrial oxidative phosphorylation (OXPHOS) complexes in the two most diverse clades of weakly electric fishes-South American Gymnotiformes and African Mormyroidea, using codon-based likelihood approaches. Our analyses reveal that although mitochondrial OXPHOS genes are generally subject to strong purifying selection, this constraint is significantly reduced in electric compared to non-electric fishes, particularly for complexes IV and V. Moreover, analyses of concatenated mitochondrial genes show strong evidence for positive selection in complex I genes on the two branches associated with the independent evolutionary origins of electrogenesis. These results suggest that adaptive evolution of proton translocation in the OXPHOS cellular machinery may be associated with the evolution of bioelectrogenesis. Overall, we find striking evidence for remarkably similar effects of electrogenesis on the molecular evolution of mitochondrial OXPHOS genes in two independently derived clades of electrogenic fishes. This article is part of the theme issue 'Linking the mitochondrial genotype to phenotype: a complex endeavour'.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».