Accessing Biobanks to Obtain Human Biomonitoring Data
Notice bibliographique
Résumé
Background: The use of human biomonitoring data allows direct and more precise assessment of the distribution of exposure in a given population. In Canada, biomonitoring data in the general population has been continuously measured since 2007, by the Canadian Health Measures Survey (CHMS). Integrated within the CHMS, the biobank is a nationally representative cohort to facilitate novel health research.Objective: Some of the Chemical Management Plan’s priority substances; Al, Bi, Ce, Cr, Ge, La, Li, Nd, Pr, Ti, Te and Y were not included in the CHMS. After obtaining approval from relevant authorities, approx. 6000 whole blood samples from the CHMS biobank were accessed to determine metal concentrations by Inductively Coupled Plasma Spectrometry.Method: Resultant concentrations were expected to be at ppt or ppb levels. The main challenges were: possible leaching of metals from storage and associated materials, non-homogeneity of blood samples, transportation of samples and analytical issues related to testing a large batch of samples in the absence of data for comparison. Leaching was addressed by sequential testing of de-ionized water and blood, mimicking the procedure from the withdrawal of the blood samples, storage and analysis. Non-homogeneity of the samples and possible contamination during analysis were addressed by reproducibility studies. Throughout the project (1.5 years), accuracy, recovery, reproducibility, and contamination were assessed using Certified Blood Reference Materials, a control spiked blood sample, and Method Blanks along with each analytical batch.Results: Recoveries were in an acceptable range of 70-130%; the majority between 80-120%, with an inter assay CV% ranging from 3-11%. Leach testing showed no contamination from the storage or associated materials used for Bi, Ce, Cr, Ge, La, Li, Nd, Pr, Te, except for Y, which had minor contamination close to the detection limit from materials associated with blood withdrawal.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,028 | 0,031 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,004 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,042 | 0,038 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».