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Enregistrement W2990030464 · doi:10.1136/neurintsurg-2019-015471

Automatic segmentation of cerebral infarcts in follow-up computed tomography images with convolutional neural networks

2019· article· en· W2990030464 sur OpenAlexaff
Renan Sales Barros, Manon L. Tolhuisen, Anna M.M. Boers, Ivo G.H. Jansen, Елена Пономарева, Diederik W.J. Dippel, Aad van der Lugt, Robert J. van Oostenbrugge, Wim H. van Zwam, Olvert A. Berkhemer, Mayank Goyal, Andrew M. Demchuk, Bijoy K. Menon, Peter Mitchell, Michael D. Hill, Tudor G. Jovin, Antoni Dávalos, Bruce Campbell, Jeffrey L. Saver, Yvo B.W.E.M. Roos, Keith W. Muir, Phil White, Serge Bracard, Françis Guillemin, Sílvia D. Olabarriaga, Charles B.L.M. Majoie, Henk A. Marquering

Notice bibliographique

RevueJournal of NeuroInterventional Surgery · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Ischemic Stroke Management
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesITEA3National Institute for Health and Care Research
Mots-clésMedicineConvolutional neural networkComputed tomographyArtificial intelligenceSegmentationRadiologyTomographyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: Infarct volume is a valuable outcome measure in treatment trials of acute ischemic stroke and is strongly associated with functional outcome. Its manual volumetric assessment is, however, too demanding to be implemented in clinical practice. OBJECTIVE: To assess the value of convolutional neural networks (CNNs) in the automatic segmentation of infarct volume in follow-up CT images in a large population of patients with acute ischemic stroke. MATERIALS AND METHODS: We included CT images of 1026 patients from a large pooling of patients with acute ischemic stroke. A reference standard for the infarct segmentation was generated by manual delineation. We introduce three CNN models for the segmentation of subtle, intermediate, and severe hypodense lesions. The fully automated infarct segmentation was defined as the combination of the results of these three CNNs. The results of the three-CNNs approach were compared with the results from a single CNN approach and with the reference standard segmentations. RESULTS: The median infarct volume was 48 mL (IQR 15-125 mL). Comparison between the volumes of the three-CNNs approach and manually delineated infarct volumes showed excellent agreement, with an intraclass correlation coefficient (ICC) of 0.88. Even better agreement was found for severe and intermediate hypodense infarcts, with ICCs of 0.98 and 0.93, respectively. Although the number of patients used for training in the single CNN approach was much larger, the accuracy of the three-CNNs approach strongly outperformed the single CNN approach, which had an ICC of 0.34. CONCLUSION: Convolutional neural networks are valuable and accurate in the quantitative assessment of infarct volumes, for both subtle and severe hypodense infarcts in follow-up CT images. Our proposed three-CNNs approach strongly outperforms a more straightforward single CNN approach.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,538

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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