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Enregistrement W2990112117 · doi:10.1111/1462-2920.14877

Niche separation within aerobic methanotrophic bacteria across lakes and its link to methane oxidation rates

2019· article· en· W2990112117 sur OpenAlexafffund
Paula C. J. Reis, Shoji D. Thottathil, Clara Ruiz‐González, Yves T. Prairie

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAnaerobic oxidation of methaneWater columnGammaproteobacteriaEnvironmental chemistryBiologyMethaneNicheEcologyTemperate climateAbundance (ecology)BacteriaChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Lake methane (CH 4 ) emissions are largely controlled by aerobic methane‐oxidizing bacteria (MOB) which mostly belong to the classes Alpha‐ and Gammaproteobacteria (Alpha‐ and Gamma‐MOB). Despite the known metabolic and ecological differences between the two MOB groups, their main environmental drivers and their relative contribution to CH 4 oxidation rates across lakes remain unknown. Here, we quantified the two MOB groups through CARD‐FISH along the water column of six temperate lakes and during incubations in which we measured ambient CH 4 oxidation rates. We found a clear niche separation of Alpha‐ and Gamma‐MOB across lake water columns, which is mostly driven by oxygen concentration. Gamma‐MOB appears to dominate methanotrophy throughout the water column, but Alpha‐MOB may also be an important player particularly in well‐oxygenated bottom waters. The inclusion of Gamma‐MOB cell abundance improved environmental models of CH 4 oxidation rate, explaining part of the variation that could not be explained by environmental factors alone. Altogether, our results show that MOB composition is linked to CH 4 oxidation rates in lakes and that information on the MOB community can help predict CH 4 oxidation rates and thus emissions from lakes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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